SDS-PAGE/聚丙烯酰胺凝胶电泳原理与实验步骤
					
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                            sds聚丙烯酰胺凝胶电蛋白表达与纯化 | 
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十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)作为聚丙烯酰胺凝胶电泳技术的一种,可测定蛋白质的分子量,对蛋白质组分进行分离、分析、纯化、定性、定量以及少量的制备。在蛋白表达与纯化中有着广泛应用,尤其是在原核蛋白表达中,有着不可替代的作用。
1.SDS-PAGE的类型
 
 
http://www.zoonbio.com/protein/image/flat-bed-electrnphores.jpg
 
2.SDS-PAGE的原理
 
 
与常规PAGE类似,不连续SDS-PAGE对蛋白质的分离除了基于分子筛效应外,还基于其对样品的浓缩效应。
3.SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳的实验方法
样品缓冲液中须含有3~4倍于蛋白质的SDS以及足够断裂二硫键的β-巯基乙醇或二硫苏糖醇,而且蛋白须完全变性展开。由于每克伸展的蛋白质结合1.4g单体SDS,因此通常在样品缓冲液中加1%~2%(10~20g/L)SDS,在凝胶及电泳缓冲液中加0.1%SDS。
制胶
SDS-PAGE多采用不连续的电泳方式,其制胶方法与常规PAGE的制胶方法基本一致,但由于凝胶中含有SDS,容易起泡,低温下又易结晶析出,因此单体储备液不需抽气,聚合时的凝胶也不适宜在4放置。制胶模具的准备也同常规PAGE相同。下面就介绍不连续电泳中的阳极电泳的制胶方法。
(1)凝胶储备液的配制
 丙烯酰胺储备液T=30%,C固定,2.6%~3%。
 4×分离胶缓冲液 如pH=8.8、1.5mol/L Tris-HCl缓冲液,含0.4%SDS。
 4×浓缩胶缓冲液 如pH=6.8、0.5mol/L Tris-HCl缓冲液,含0.4%SDS。
 10%过硫酸铵溶液(AP)。
注:丙烯酰胺是神经毒剂,应戴手套操作。电泳时的试剂应达到电泳纯,并使用重蒸水配制溶液。
(2)分离胶配方
| A液/ml | B液/ml | 重蒸水/ml | 10%AP/μl | TEMED/μl | 
| x/30×10=x/3 | 10/4=2.5 | 10-x/3-2.5 | 约50 | 3~5 | 
根据聚合的快慢来调节AP和TEMED的用量,使凝胶在20~60min内聚合。
(3)制备浓缩胶
制备样品和加样
5×样品缓冲液:pH=6.8、0.06mol/L (0.4mol/L)Tris-Hcl缓冲液,含25%(50%)甘 油、2%(10%)SDS、5% (体积分数)巯基乙醇和0.1%溴酚蓝。
将蛋白质溶液与5×样品缓冲液以4:1(体积比)的比例混合(如果蛋白质溶液浓度过高,需预先脱盐处理)后,在100水浴中加热3~5min,使蛋白质充分变性,再于10000r/min离心5min,取上清加样。
电泳
电泳缓冲液:pH=8.3,0.025mol/L Tris-0.192mol/L Gly缓冲液,含0.1%SDS。
1、带有烷基化作用的还原SDS处理:碘乙酸胺的烷基化作用很好的并且长期的保护SH基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕集过量的DTT,以防止银染时的纹理现象。
染色和检测
(1)考马斯亮蓝法,在SDS-PAGE后,凝胶的固定和染色时间应比常规PAGE的长1倍左右,或用多倍体积染色液染色,以排除SDS的影响。
(2)银染法,在电泳后染色之前,必须将凝胶多次漂洗,以除去SDS。
4.影响分离结果的因素
缓冲系统
在SDS对蛋白质的助溶作用以及负电荷的包裹作用影响下,蛋白质的分离仅依据亚基的分子大小,因此缓冲系统的选择比较简单,只要利于分离并保持蛋白质的稳定以及不与SDS发生相互作用即可。常用的缓冲系统有 Tris-Gly缓冲液,其余如磷酸缓冲液(多用于连续电泳)、Tris-醋酸盐缓冲液、Tris-硼酸盐缓冲液、咪唑缓冲液以及SDS-尿素系统 (用于分离低分子量蛋白样品)。离子强度一般为0.01~0.2mol/L。
SDS-PAGE为阳极电泳,在凝胶缓冲液中加入 0.1%SDS,在样品缓冲 液中加1% ~2%SDS和1%~6%巯基乙醇 (或3%二硫苏糖醇),并加适量溴酚蓝,在电极缓冲液中加0.1%SDS,不连续电泳的凝胶缓冲液和样品缓冲液中还需加适量甘油。
凝胶浓度
由于凝胶浓度决定凝胶孔径大小,而凝胶孔径影响电泳效果 (即凝胶的分子筛效应)。特别是对于SDS-PAGE,由于电泳分离只取决于SDS-蛋白质亚基胶束的大小,因此凝胶浓度的选择尤为重要。应根据样品中蛋白质的分子量范围选择合适的凝胶浓度
| C=2.6% | C=5% | ||
| 凝胶浓度(T)/% | 分子量范围/kDa | 凝胶浓度(T)/% | 分子量范围/kDa | 
| 
5 10 15 20  | 
25-200 10-70 <50 <40  | 
5 10 15 20  | 
60-170 20-100 10-50 5-40  | 
本文转自钟鼎生物官网www.zoonbio.com

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