在蛋白质染色方法中，目前以考马斯亮蓝染色最为常用。因为它既克服了氨基黑染色灵敏度不高的限制，又比银染简便易操作，并且染色时间短，一般半小时内即可检测到蛋白电泳条带。

考马斯亮蓝染料的灵敏度：  

    考马斯亮蓝染色可以达到0.2-0.5 μg（200-500 ng），最低可检出100ng蛋白；银染的灵敏度比考染高将近100倍，最低可以检出2 ng蛋白。  通过考马斯亮蓝染色条带的深浅粗细，可以大致判断该条带有多少蛋白。

考马斯亮蓝染料的原理： 

    考马斯亮蓝有G-250和R-250两种。其中R为红蓝色，G为绿蓝色。R-250即三苯基甲烷，每个分子含有两个SO3H基团，偏酸性，与氨基黑一样也是结合到蛋白质的碱性基团上。G-250即二甲花青亮蓝，是一种甲基取代的三苯基甲烷。G-250在游离状态下呈红色，最大吸收峰在465nm。当它与蛋白质结合后变成深蓝色，最大吸收峰变为595nm。蛋白质含量在1-1000μg范围内，蛋白质-染料复合物在595nm处的吸光度与蛋白质含量成正比，故可用比色法测定。 

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