南昌大学食品学院源于1985年创办的原江西工业大学食品工程系和江西大学食品科学系。1987年江西工业大学成立“食品工业学院”，时任中共中央政治局常委陈云为学院题名。1993年江西大学和江西工业大学合并组建南昌大学，原江西工业大学食品工业学院与原江西大学食品科学系合并，组建南昌大学食品工业学院，1994年与生物科学工程系重组为南昌大学生命科学与食品工程学院。2014年因学科发展需要，成立食品学院。

学院现有食品科学国家重点学科（全省共2个）、“211”工程重点建设学科和江西省重点学科。拥有我国高校食品科学领域唯一的国家重点实验室---食品科学与技术国家重点实验室，农产品生物高效转化技术国家地方联合工程研究中心、中国-加拿大食品科学与技术联合实验室（南昌）以及食品安全国家示范型国际科技合作基地等4个国家级科研平台；有食品科学教育部重点实验室和生物质转化教育部工程研究中心等省部级科研平台15个，形成集科学基础研究、关键核心技术和项目成果转化为一体，产学研用联动的高效创新平台（目前全国同时拥有国家重点实验室和国家工程中心的双平台布局的高校仅两所）。

在2017年12月公布的全国第四轮学科评估中, 南昌大学食品科学与工程学科（0832）位居食品学科全国第三，成为江西省高校学科排名首个进入全国前三的学科，是江西省唯一获评A级的学科；2017年食品学院食品科学技术与健康学科群入选“南昌大学世界一流学科引领计划”； 2020年1月《美国新闻与世界报道》 （《U.S.News & World Report 》）发布的“US News 全球大学排名”（US News Best Global Universities）中，南昌大学农业科学学科（以食品为主）位居全球第19位；软科世界一流学科排名，南昌大学食品科学与工程排名第9位； 谢明勇、聂少平、张国文、谢建华四位教授入选科睿唯安全球“高被引科学家”。李欣教授团队入选中国青年女科学家奖团队。根据美国ESI（Essential Science Indicators，基本科学指标库）公布的数据显示，2021年9月，南昌大学农业科学学科（以食品为主）进入ESI全球排名前1.03‰； 标志着我院食品学科已经进入了国际高水平学科行列，正向世界一流学科稳步前进！

学院现有食品科学与工程博士后科研流动站；食品科学与工程一级学科博士学位授权点、公共卫生与预防医学一级学科博士学位授权点（与公卫学院共建，已公示）以及生物与医药专业博士学位授权点（已公示）；有一级学科学术型硕士学位授权点和两个专业学位硕士学位授权点；在职人员以同等学力申请硕士学位授予权。 在全省乃至全国都有着良好的知名度、社会影响力、美誉度和较强的竞争力。

学科现有教职工179人，其中专任教师140人、 正高62人、 副教授43人， 具有博士学位114人。具有海外一年以上留学经历教师超过60% 。拥有国际食品科学院院士、国务院学位委员会学科评议组成员(食品学科组召集人之一)、国家海外引才计划创新人才、 国家海外引才计划青年人才、国家高层次人才特殊支持计划科技创新领军人才、 国家高层次人才特殊支持计划青年人才、教育部国家级重大人才工程特聘教授、 教育部国家重大人才工程青年学者、 国家杰出青年科学基金项目、优秀青年科学基金项目、国家百千万人才等省部级以上高层次人才称号148人次，其中国家级人才称号41人次。

学院下设食品科学与工程系、食品营养与安全系、食品发酵与生物工程系，设有食品科学与工程、食品质量与安全、生物工程3个本科专业，食品科学与工程专业获批国家级特色专业和省级品牌专业并列入教育部首批“卓越计划”。现有全日制在校生2045人，其中博士研究生163人、硕士研究生921人、本科生961人。