薪酬体系设计完成后，人力资源部门应根据任职者的绩效历史记录、能力素质、员工任职资格情况等，确定套改方案，根据方案计算出改革前后员工的变化情况，以便实现薪酬总额控制。总薪酬成本控制的目的在于加强公司对人工成本的控制力度，使总薪酬成本的预算和实际开支与公司的经营状况相适应，增强公司的应变能力。套改时，对于一些特殊员工处理提供建议，如高于或低于方案中薪酬水平员工的处理建议。

同时，要制定相关的薪酬管理制度与流程，如：确定薪酬总额管理制度与流程;确定日常薪酬计算与发放制度与流程;确定员工加薪制度与流程;新员工薪酬管理制度等。从制度上规定员工薪酬开始入级和今后岗位调整规则。

薪酬调整包括企业总体自然调整、岗位变动调整和绩效调整。在岗位绩效薪酬中应该对个人薪酬调整和绩效考评的关系做出规定。此外，还有对薪酬发放的时间、发放形式做出适合企业情况的规定，如是否采取薪酬保密制度。