干货|分子生物学之常用试剂配制方法
(2018-12-18 17:38:44)
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教育 |
一、电泳类试剂
1.50×Tris-乙酸(TAE,pH=8.5)缓冲液
成分及终浓度 |
配制100mL溶液各成分的用量 |
|
|
【注意事项】
1.各物质的称量务必准确,以确保缓冲液处于最佳状态。
2.不要使用实验室已配制的Tris缓冲液来配制2mol/L Tris碱,因为实验室常见的Tris缓冲液往往使用了HCl调节了pH,成为了Tris-HCl缓冲液,而此处是使用纯Tris,配制Tris-乙酸缓冲液。下述TBE中同样也是不可用Tris-HCl缓冲液来配制。
2.5×Tris-硼酸(TBE)缓冲液
成分及终浓度 |
配制1L溶液各成分的用量 |
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|
【注意事项】
1.TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5倍的溶液,使用0.5倍的稀释液。
3.6×loading buffer 室温保存
在0.6%、1%、2%的琼脂糖凝胶电泳中它们分别与1kb、0.6kb、0.15kb的双链DNA片断的泳动率大致相同。
【注意事项】
1.该缓冲液用于DNA电泳;
2.该缓冲液中含色素溴酚蓝(BromophenolBlue)、二甲苯腈蓝FF(Xylene Cyanol FF)两种染料(浓度都是0.05%),溴酚蓝在琼脂糖凝胶(0.5% ~ 1.4%)中约与300 bp的双链线状DNA的迁移速度相同,而二甲苯腈蓝FF则与4 kbp的双链线状DNA的迁移速度相等。
4.10×loading buffer
【注意】
1.适合于RNA电泳。
2. 制品中含有SDS, 可即刻停止各种酶促反应。向酶促反应液中加入1/10量的本制品,即可停止反应,此溶液可直接用于琼脂糖凝胶电泳。
3.10X loading buffer 中仅有色素溴酚蓝(Bromophenol Blue)一种染料(浓度0.05%)。
二、培养基类
1.LB培养基
(1)将下列组分溶解在0.9L水中:
蛋白胨 |
10g |
酵母提取物 |
5g |
氯化钠 |
10g |
如果需要用4M NaOH(约0.5mL)调整pH至7.0,再补足水至1L。然后分装于250mL锥形瓶并用泡沫或棉塞或封口膜进行封口,121灭菌15—20min
(2)固体培养基
在液体培养基的基础上,加入7g琼脂粉并煮沸,调节pH后定容至1L。
【注意事项】
1.胰蛋白胨和酵母提取粉易粘连称量纸,故称量完成后将称量纸与药品一起放到去离子水中,然后在加热过程中将称量纸上的药品清洗干净取出。
2.用双层封口膜封口灭菌。
3.只要培养基保持澄清状态,其可认为是无菌的,可以继续使用。
2.MS培养基
母液种类 |
成分 |
规定用量/(mg·L-1) |
称取量/mg
|
配制体积/mL
|
扩大倍数 |
配1L MS培养基吸取量/mL |
大量元素 |
KNO3 |
1900 |
19000 |
500 |
20× |
50 |
NH4NO3 |
1650 |
16500 |
||||
MgSO4·7H2O |
370 |
3700 |
||||
KH2PO4 |
170 |
1700 |
||||
CaCl2·2H2O |
440 |
4400 |
||||
微量元素 |
MnSO4·4H2O |
22.3 |
1115 |
500 |
100× |
10 |
ZnSO4·7H2O |
8.6 |
430 |
||||
H3BO3 |
6.2 |
310 |
||||
KI |
0.83 |
41.5 |
||||
Na2MoO4·2H2O |
0.25 |
12.5 |
||||
CuSO4·5H2O |
0.025 |
1.25 |
||||
CoCl2·6H2O |
0.025 |
1.25 |
||||
铁盐 |
Na2-EDTA |
37.3 |
1685 |
250 |
200× |
5 |
FeSO4·7H2O |
27.8 |
1390 |
||||
维生素和氨基酸 |
甘氨酸 |
2.0 |
100 |
500 |
100× |
10 |
盐酸硫胺素(VB1) |
0.4 |
20 |
||||
盐酸吡哆素(VB6) |
0.5 |
25 |
||||
烟酸 |
0.5 |
25 |
||||
肌醇 |
100 |
5000 |
注:阴影的两种试剂单独配制成200×的,否则大量元素容易形成沉淀
三 抗生素类
简介
1.抗生素溶液的配置一般用无菌水或醇类充当溶剂。
2.以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理,用无菌水配的用0.45或0.22um无菌过滤器过滤除菌(个人经验,只要将盛装抗生素溶液的容器灭菌处理后可不用过滤除菌)。
3.所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存,也可用锡箔纸包裹。
4.镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB培养基)。
5.抗生素配制出以后4可保存3个月,-20可保存一年。
6.配制完成后注意分装。
常用抗生素
1.氨苄青霉素(Amp)(100mg/mL)
溶解1g氨苄青霉素钠盐于足量的无菌水中,最后定容至10mL,必要时可以用0.45或0.22um无菌过滤器过滤。分装成小份于-20可贮存一年,4可贮存3个月。常以25ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。
2.羧苄青霉素(Car)(50mg/mL)
溶解0.5g羧苄青霉素二钠盐于足量的水中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以25ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。
3.甲氧西林(Met)(100mg/mL)
溶解1g甲氧西林钠于足量的水中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以37.5ug/mL终浓度与100ug/mL氨苄青霉素一起添加于生长培养基。
4.硫酸卡那霉素(kan)(10mg/mL)
溶解100mg卡那霉素于足量的无菌水中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以10ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。
5.氯霉素(Chl)(25mg/mL)
6.链霉素(streptomycin)(50mg/mL)
溶解0.5g链霉素硫酸盐于足量的无水乙醇中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以10ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。
7.萘啶酮酸(nalidixic
acid)(5mg/mL)
溶解50mg萘啶酮酸钠盐于足量的水中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以15ug/mL的终浓度添加于生长培养基。
8.四环素(tetracyyline)(10mg/mL)
溶解100mg四环素盐酸盐于足量的水中,或者将无碱的四环素溶于无水乙醇,定容至10mL。分装成小份用铝箔包裹装液管以免溶液见光,于-20贮存。常以10ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。
[注意事项]
1.不能高温灭菌的抗生素必须采用过滤灭菌。
2.以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。
3.镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB培养基)。
四、核酸提取类
1. 10%十二烷基硫酸钠(SDS)溶液
配制量:100mL
[配制方法]在90mL无菌水中溶解10g电泳级SDS,加热至68助溶,加入几滴浓盐酸调节溶液的pH值至7.2,加水定容至1L,分装备用。
[注意事项]
1.SDS的微细晶粒易扩散,因此称量时要戴面罩,称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS,10%SDS溶液无须灭菌(高温条件下分解会产生CO等有毒气体)。
2.若有沉淀形成,可以适当水浴加热溶解后继续使用。
3.区别于十二烷基磺酸钠。
4.pH极易调过需小心
2.1%DEPC(焦碳酸二乙酯)处理水
配制量:1L
[配制方法]加1mL DEPC 于 999ml水中,用磁力搅拌器在37条件下搅拌4h以上,静置过夜,在121 条件下高温灭菌20min,以使残余的DEPC失活。
[注意事项]
1.DEPC具有强烈的致癌性,故操作时必须戴双层口罩,双层手套于通风厨中进行。
2.此处配制的DEPC水用于RNA提取中70%乙醇的配制及RNA的溶解。
3.TE缓冲液
配制量:100mL。
【配制方法】:量取下列溶液于100mL烧杯中
成分及终浓度 |
配制100mL溶液各成分的用量 |
10mmol/L Tris-HCl |
1mL 1mol/L Tris-HCl(pH8.0,25) |
然后向烧杯中加入80mL去离子水,均匀混合,最后定容至100mL,高温高温高压灭菌后使用。
用途:用于悬浮和贮存DNA
保存:室温长期保存。
4.1MTris缓冲液(Tris-HCl buffer)
配制量:100mL。
【配制方法】:将12.1g的Tris碱溶解于约70mL去离子水中,适当加热溶解,再根据所要求的pH(25下)加一定量的浓盐酸(11.6N),用水调整终体积至100mL。
浓盐酸的体积(mL) |
pH |
0.86 |
9.0 |
【注意事项】
1.称量时应戴口罩,避免吸入Tris粉末。
2.应使溶液冷却至室温时再调PH值,因为溶液的PH值随温度的变化差异很大,温度每升高1,溶液的pH值大约降低0.03个单位。
3.溶液若呈现黄色,则暗含该Tris质量较差,质量较差,不应使用。
4.很多类型的PH计的电极不适合精确测量其PH值,故根据说明书选择合适的电极。
保存:室温可长期保存。
附:温度对50mmol/L Tris·HCl液pH值的影响
4 |
25 |
37 |
8.1 |
7.5 |
7.2 |
8.2 |
7.6 |
7.3 |
8.3 |
7.7 |
7.4 |
8.4 |
7.8 |
7.5 |
8.5 |
7.9 |
7.6 |
8.6 |
8.0 |
7.7 |
8.7 |
8.1 |
7.8 |
8.8 |
8.2 |
7.9 |
5. 3M醋酸钠(PH 5.2)
配制量:100mL。
【配制方法】:称取40.8gNaOAc.3H2O置于100mL烧杯中,加入约40mL去离子水搅拌溶解,然后用冰醋酸调Ph至5.2,最后定容至100mL,高温高温高压灭菌后使用。
保存条件:室温保存。
【注意事项】:
1.此溶液常用于沉淀DNA,中和磷酸基团的负电荷,当其pH低于5.0时不可使用。
2.配制时加入去离子水为40ml因为冰醋酸调节pH时需要的冰醋酸量较大,故为保证最后不超过定容体积,去离子水不易加入过多。