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干货|分子生物学之常用试剂配制方法

(2018-12-18 17:38:44)
标签:

教育


一、电泳类试剂

1.50×Tris-乙酸(TAE,pH=8.5)缓冲液

成分及终浓度

配制100mL溶液各成分的用量

 2mol/L Tris碱
 1mol/L 乙酸
 100 mmol/L EDTA
 

 24.2g
 5.71 mL的冰乙酸(17.4 mol/L)
 3.72gNa2EDTA·2H2O
 补足100mL

【注意事项】

1.各物质的称量务必准确,以确保缓冲液处于最佳状态。

2.不要使用实验室已配制的Tris缓冲液来配制2mol/L Tris碱,因为实验室常见的Tris缓冲液往往使用了HCl调节了pH,成为了Tris-HCl缓冲液,而此处是使用纯Tris,配制Tris-乙酸缓冲液。下述TBE中同样也是不可用Tris-HCl缓冲液来配制。

2.5×Tris-硼酸(TBE)缓冲液

成分及终浓度

配制1L溶液各成分的用量

 445 mmol/L Tris碱
 445 mmol/L 硼酸盐
 10 mmol/L EDTA
 

 54g
 27.5g 硼酸
 3.72 g Na2EDTA·2H2O(pH  8.0)
 补足1L

【注意事项】

1.TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5倍的溶液,使用0.5倍的稀释液。

3.6×loading buffer 室温保存

在0.6%、1%、2%的琼脂糖凝胶电泳中它们分别与1kb、0.6kb、0.15kb的双链DNA片断的泳动率大致相同。

【注意事项】

1.该缓冲液用于DNA电泳;

2.该缓冲液中含色素溴酚蓝(BromophenolBlue)、二甲苯腈蓝FF(Xylene Cyanol FF)两种染料(浓度都是0.05%),溴酚蓝在琼脂糖凝胶(0.5% ~ 1.4%)中约与300 bp的双链线状DNA的迁移速度相同,而二甲苯腈蓝FF则与4 kbp的双链线状DNA的迁移速度相等。

4.10×loading buffer

【注意】

1.适合于RNA电泳。

2. 制品中含有SDS, 可即刻停止各种酶促反应。向酶促反应液中加入1/10量的本制品,即可停止反应,此溶液可直接用于琼脂糖凝胶电泳。

3.10X loading buffer 中仅有色素溴酚蓝(Bromophenol Blue)一种染料(浓度0.05%)。

 

二、培养基类

1.LB培养基
(1)将下列组分溶解在0.9L水中:

蛋白胨

10g

酵母提取物

5g

氯化钠

10g

如果需要用4M NaOH(约0.5mL)调整pH至7.0,再补足水至1L。然后分装于250mL锥形瓶并用泡沫或棉塞或封口膜进行封口,121灭菌15—20min

(2)固体培养基

在液体培养基的基础上,加入7g琼脂粉并煮沸,调节pH后定容至1L。

【注意事项】

1.胰蛋白胨和酵母提取粉易粘连称量纸,故称量完成后将称量纸与药品一起放到去离子水中,然后在加热过程中将称量纸上的药品清洗干净取出。

2.用双层封口膜封口灭菌。

3.只要培养基保持澄清状态,其可认为是无菌的,可以继续使用。

2.MS培养基

母液种类

成分

规定用量/(mg·L-1

称取量/mg

 

配制体积/mL

 

扩大倍数

配1L MS培养基吸取量/mL

大量元素

KNO3

1900

19000

500

20×

50

NH4NO3

1650

16500

MgSO4·7H2O

370

3700

KH2PO4

170

1700

CaCl2·2H2O

440

4400

微量元素

MnSO4·4H2O

22.3

1115

500

100×

10

ZnSO4·7H2O

8.6

430

H3BO3

6.2

310

KI

0.83

41.5

Na2MoO4·2H2O

0.25

12.5

CuSO4·5H2O

0.025

1.25

CoCl2·6H2O

0.025

1.25

铁盐

Na2-EDTA

37.3

1685

250

200×

5

FeSO4·7H2O

27.8

1390

维生素和氨基酸

甘氨酸

2.0

100

500

100×

10

盐酸硫胺素(VB1

0.4

20

盐酸吡哆素(VB6

0.5

25

烟酸

0.5

25

肌醇

100

5000

注:阴影的两种试剂单独配制成200×的,否则大量元素容易形成沉淀

三 抗生素类

简介

1.抗生素溶液的配置一般用无菌水或醇类充当溶剂。

2.以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理,用无菌水配的用0.45或0.22um无菌过滤器过滤除菌(个人经验,只要将盛装抗生素溶液的容器灭菌处理后可不用过滤除菌)。

3.所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存,也可用锡箔纸包裹。

4.镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB培养基)。

5.抗生素配制出以后4可保存3个月,-20可保存一年。

6.配制完成后注意分装。

常用抗生素

1.氨苄青霉素(Amp)(100mg/mL)
溶解1g氨苄青霉素钠盐于足量的无菌水中,最后定容至10mL,必要时可以用0.45或0.22um无菌过滤器过滤。分装成小份于-20可贮存一年,4可贮存3个月。常以25ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。

2.羧苄青霉素(Car)(50mg/mL)
溶解0.5g羧苄青霉素二钠盐于足量的水中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以25ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。

3.甲氧西林(Met)(100mg/mL)
溶解1g甲氧西林钠于足量的水中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以37.5ug/mL终浓度与100ug/mL氨苄青霉素一起添加于生长培养基。

4.硫酸卡那霉素(kan)(10mg/mL)
溶解100mg卡那霉素于足量的无菌水中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以10ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。

5.氯霉素(Chl)(25mg/mL)  
溶解250mg氯霉素足量的无水乙醇中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以12.5ug/mL~25ug/mL的终浓度添加于生长培养基。

6.链霉素(streptomycin)(50mg/mL)
溶解0.5g链霉素硫酸盐于足量的无水乙醇中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以10ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。

7.萘啶酮酸(nalidixic acid)(5mg/mL)
溶解50mg萘啶酮酸钠盐于足量的水中,最后定容至10mL。分装成小份于-20贮存。常以15ug/mL的终浓度添加于生长培养基。

8.四环素(tetracyyline)(10mg/mL)
溶解100mg四环素盐酸盐于足量的水中,或者将无碱的四环素溶于无水乙醇,定容至10mL。分装成小份用铝箔包裹装液管以免溶液见光,于-20贮存。常以10ug/mL~50ug/mL的终浓度添加于生长培养基。

[注意事项]

1.不能高温灭菌的抗生素必须采用过滤灭菌。

2.以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。

3.镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB培养基)。

 

四、核酸提取类

 

1. 10%十二烷基硫酸钠(SDS)溶液

配制量:100mL

[配制方法]在90mL无菌水中溶解10g电泳级SDS,加热至68助溶,加入几滴浓盐酸调节溶液的pH值至7.2,加水定容至1L,分装备用。

[注意事项]

1.SDS的微细晶粒易扩散,因此称量时要戴面罩,称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS,10%SDS溶液无须灭菌(高温条件下分解会产生CO等有毒气体)。

2.若有沉淀形成,可以适当水浴加热溶解后继续使用。

3.区别于十二烷基磺酸钠。

4.pH极易调过需小心

2.1%DEPC(焦碳酸二乙酯)处理水

配制量:1L

[配制方法]加1mL DEPC 于 999ml水中,用磁力搅拌器在37条件下搅拌4h以上,静置过夜,在121 条件下高温灭菌20min,以使残余的DEPC失活。

[注意事项]

1.DEPC具有强烈的致癌性,故操作时必须戴双层口罩,双层手套于通风厨中进行。

2.此处配制的DEPC水用于RNA提取中70%乙醇的配制及RNA的溶解。

3.TE缓冲液

配制量:100mL。

【配制方法】:量取下列溶液于100mL烧杯中

成分及终浓度

配制100mL溶液各成分的用量

10mmol/L Tris-HCl
 1mmol/L EDTA
  

1mL 1mol/L Tris-HCl(pH8.0,25)
 200ul 0.5 mol/L EDTA(pH 8.0)

然后向烧杯中加入80mL去离子水,均匀混合,最后定容至100mL,高温高温高压灭菌后使用。

用途:用于悬浮和贮存DNA

保存:室温长期保存。

4.1MTris缓冲液(Tris-HCl buffer)

配制量:100mL。

【配制方法将12.1g的Tris碱溶解于约70mL去离子水中,适当加热溶解,再根据所要求的pH(25下)加一定量的浓盐酸(11.6N),用水调整终体积至100mL。

浓盐酸的体积(mL)

pH

0.86
 1.4
 2.1
 2.85
 3.8
 4.6
 5.6
 6.6
 7.13
 7.6

9.0
 8.8
 8.6
 8.4
 8.2
 8.0
 7.8
 7.6
 7.4
 7.2

【注意事项】

1.称量时应戴口罩,避免吸入Tris粉末。

2.应使溶液冷却至室温时再调PH值,因为溶液的PH值随温度的变化差异很大,温度每升高1,溶液的pH值大约降低0.03个单位。

3.溶液若呈现黄色,则暗含该Tris质量较差,质量较差,不应使用。

4.很多类型的PH计的电极不适合精确测量其PH值,故根据说明书选择合适的电极。

保存:室温可长期保存。

附:温度对50mmol/L Tris·HCl液pH值的影响

4

25

37

8.1

7.5

7.2

8.2

7.6

7.3

8.3

7.7

7.4

8.4

7.8

7.5

8.5

7.9

7.6

8.6

8.0

7.7

8.7

8.1

7.8

8.8

8.2

7.9

 

5. 3M醋酸钠(PH 5.2)

配制量:100mL。

【配制方法】:称取40.8gNaOAc.3H2O置于100mL烧杯中,加入约40mL去离子水搅拌溶解,然后用冰醋酸调Ph至5.2,最后定容至100mL,高温高温高压灭菌后使用

保存条件:室温保存。

【注意事项】:

1.此溶液常用于沉淀DNA,中和磷酸基团的负电荷,当其pH低于5.0时不可使用。

2.配制时加入去离子水为40ml因为冰醋酸调节pH时需要的冰醋酸量较大,故为保证最后不超过定容体积,去离子水不易加入过多。


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