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郝玲娟xueer
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POSCAR关于分数坐标与笛卡尔坐标写法问题

(2017-11-14 20:36:44)
vasp在POSCAR中需要描述晶体的结构信息,可以用分数坐标,也可以用笛卡尔坐标。
分数坐标与笛卡尔坐标 
分数坐标是把点阵矢量看成是单位矢量下确定原子位置; 笛卡尔坐标是绝对坐标,是直角坐标系与斜角坐标系的统称,考虑点阵常数的大小。 
Basically, the fractional coordinates show the fraction of each unit cell vector that contributes to the position of that atom。根本上来说,分数坐标给出了每个原子在元胞的相对位置 
晶格参数: 
A (Ax   Ay   Az)         2.46          0.00         0.00  
B (Bx   By   Bz)        -1.23          2.13         0.00 
C (Cx   Cy   Cz)          0.00         0.00         10.00 
一个点的分数坐标    (a, b, c)         (0.667     0.333     0) 
x = Axa+Bxb+Cxc = 2.46*0.667-1.23*0.333+0*0=1.23        
 y = Aya+Byb+Cyc = 0*0.667+2.13*0.333+0*0=0.71         
z = Aza+Bzb+Czc = 0*0.667+0*0.333+10*0=0 
这个点的笛卡尔坐标 (x, y, z)           (1.23      0.71     0) 
所以,笛卡尔坐标并不是原子在我们作为参考的直角坐标系中的绝对位置,而是在元胞基矢构成坐标系中,原子的绝对位置,而分数坐标,就是原子在元胞基矢构成坐标系中原子的相对位置。对于一个斜角坐标系,显然原子的相对位置比较好判断,所以,我们一般在POSCAR中用到的是其分数坐标,如果需要用到笛卡尔坐标,就用上面的公式转换。

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