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M217叶赫型所属的Y-SNP单倍群分析

(2017-03-23 19:09:58)
标签:

y染色体

历史

民族

y-str

y-snp单倍群

分类: Y染色体研究

M217叶赫型是一个主要分布于东北亚人群中的Y染色体类型,因为其属于单倍群M217,与叶赫部密切相关,我命名其为M217叶赫型。

 

M217叶赫型核心型的17Y-STR为:

DYS1915

DYS389I13

DYS389b16

DYS39024

DYS39110

DYS39211

DYS39314

DYS43714

DYS43810

DYS43911

DYS44821

DYS45616

DYS45819

DYS63523

Y GATA H411

DYS38512-12

 

以大概率原则,与M217叶赫型可能在500年内共祖的17Y-STR标准:与M217叶赫型核心型在17Y-STR相差2步以内,且差异不在极低变点。

极低变点的划分按照YHRD2015年汇总的Y-STR突变率数据,为DYS438DYS392DYS393

 

综合2014年底以前的文献数据和YHRD数据,在中国人中没有发现1例与M217叶赫型可能在500年内共祖的人。

 

 

 

以大概率原则,与M217叶赫型可能在1000年内共祖的17Y-STR标准:与M217叶赫型核心型在17Y-STR相差4步以内。

 

综合2014年底以前的文献数据和YHRD数据,在中国人中与M217叶赫型可能在1000年内共祖的共有8例:

辽宁新宾满族3例,110H148H185He2013)。

辽宁锡伯族3例,H93H100H181Guo2015YHRD2012)。

东北少数民族1例,H180(郑立红2007)。

汉族1例(YHRD)。

 

 

不过,单倍群M217的年代超过3万年,如何确定M217叶赫型所属的年代小于等于1万年左右、大于等于3000年左右的Y-SNP单倍群?

 

 

对于M217叶赫型所属的Y-SNP单倍群,我与几位老师有较大的分歧。老师们认为该类型属于单倍群M407,而我认为该类型属于单倍群L1373的分支单倍群M48

 

 

老师们认为M217叶赫型类型属于单倍群M407是有理由的。

 

老师们的理由1

辽宁锡伯族H100M217叶赫型核心型在17Y-STR只差3步,且差异均在高变点。

同时,辽宁锡伯族H100与卡尔梅克人中的2例(H355H467Malyarchuk2013)在17Y-STR也均只差3步。由于DYS385对于东亚人而言是高变点,有的文献反映甚至突变率相当高,如果把DYS385也作为高变点,那么辽宁锡伯族H100与卡尔梅克人H355、卡尔梅克人H467不仅在17Y-STR均只差3步,而且差异均在高变点。

而卡尔梅克人H355、卡尔梅克人H467均属于单倍群M407

 

老师们的理由2

426例卡尔梅克人(Malyarchuk2013)中,与M217叶赫型核心型在17Y-STR相差7步以内的28例样本,全部属于单倍群M407M48,但最接近的2例(H463H544)与M217叶赫型在17Y-STR5步,均属于M407

而且,在426例卡尔梅克人中,与M271叶赫型核心型在17Y-STR最接近的2例样本,和与辽宁锡伯族H10017Y-STR最接近的2例样本,是不相同的样本,但其均属于单倍群M407

 

 

但我认为,M217叶赫型属于单倍群M48,理由如下。

 

我的理由1

辽宁锡伯族H100M217叶赫型核心型在17Y-STR只差3步,且差异均在高变点。

同时,辽宁锡伯族H100与日本冲绳人1例(H304Hashiyada2008)在17Y-STR只差2步,且差异均在高变点。

 

因此,只要确定日本冲绳人H304所述的Y-SNP单倍群,就能确定M217叶赫型所属的Y-SNP单倍群。

 

 

而日本冲绳人H304M48星簇核心型在17Y-STR只差5步,17Y-STR加权差异(权重为突变率取倒数再除以100,突变率以YHRD2015年数据为准)为26.16。这样的差异可以高度确定日本冲绳人H304属于单倍群M48

 

不仅如此,我综合了具有17Y-STR的日本人数据共2891例(Hashiayada2008,Mizuno2010,Kim2011,Purps2014,Purps2014论文中的群马和静冈数据包含在Mizuno2010年论文数据中,因此只计一次),日本冲绳人H304是与M48星簇核心型在17Y-STR最接近的。

2891例日本人中理应存在M48。如Hammer2006年论文,259例日本人中,发现了3M48

如果日本冲绳人H304不属于M48,那2891例日本人数据中就没有比之更像M48的样本了,可2891例日本人中,怎么可能没有1例属于M48

 

我的理由2

日本冲绳人H304与蒙古国乌兰巴托蒙古族1(YHRD)在17Y-STR4步,17Y-STR加权差异为19.59

而这例蒙古国乌兰巴托人不仅与M48星簇核心型在17Y-STR只差1步(其DYS44821),且其23Y-STR也是典型的M48星簇。

 

 

我的理由3

日本冲绳人H304与蒙古国北部人1(YHRD)在17Y-STR4步,17Y-STR加权差异为22.12

而这例蒙古国北部人与卡尔梅克人中的2例(H326H450Malyarchuk2013)在17Y-STR只差2步。

而卡尔梅克人H326H450均属于单倍群M48

 

我的理由4

日本冲绳人H304与内蒙古蒙古族1(YHRD)在17Y-STR4步,17Y-STR加权差异为23.85

而这例蒙古国乌兰巴托人与M48星簇核心型在17Y-STR只差1步(其DYS63522),也与汉族1(H107Purps2014)在17Y-STR只差1步,而这例汉族的23Y-STR也是典型的M48星簇。

 

我的理由5

韩国人2(YHRD)与M217叶赫型在17Y-STR1步,差异在高变点,这也是综合2014年底以前的文献数据和YHRD数据,全世界仅有的2例与M217叶赫型可能在500年内共祖的样本。

2例韩国人与布里亚特蒙古人H68Kim2011)在17Y-STR5步,17Y-STR加权差异为25.79

而这例布里亚特蒙古人与M48星簇核心型在17Y-STR只差2步,且差异均在高变点,是典型的M48星簇。

 

综上所述,我认为M217叶赫型应属于单倍群M48,单倍群M48是单倍群M217的分支——单倍群L1373的分支,我又称M217叶赫型为L1373叶赫型。

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