分子对接图形化软件MGLTools-1.5.6在Windows7上界面介绍

作者：shims

在使用AutoDock分子对接程序之前需要通过分子对接图形化软件MGLTools软件处理好相应的文件。在使用AutoDock做对接需要使用到的文件主要有配体分子和受体分子的pdbqt文件，生成Grid的gpf文件，做对接的dpf文件，而这些文件都可以通过MGLTools软件生产。

如果在安装的时候创建了左面快捷方式，则可以直接通过AutoDockTools-1.5.6快捷方式启动。如果没有创建快捷方式，也可以通过开始菜单MGLTools-1.5.6目录下的AutoDockTools-1.5.6来启动。

打开的时候可能会停留在如下的提示页面，在该页面提示注册，可以现在注册或者随后提示注册，注册不是必须的。

第一部分是菜单栏，主要是一些通用的设置，如常用的File，Edit就是在生产分子对接使用的文件过程中使用的。

第二部分是快捷栏，这部分主要是一些其他的功能会用到的快捷方式区域，这里一般用不上。

第三部分是我们常使用的，也是AutoDock工具的主要业务区。Ligand：配体分子处理；Grid：对接使用的格点文件处理；Docking：分子对接文件的生成；Run：在当前环境下运行autogrid和autodock；Analyze：分析分子对接结果。

第四分部是分子结构的显示区域

第五部分是用来设置分子结构显示方式的

第六部分是分子显示区域，这部分主要是加载的分子。