通过NCBI数据库查询未知晶体结构蛋白质的氨基酸序列

作者：shims 

在使用同源建模软件Modeller 9.18软件的时候需要知道未知晶体结构的蛋白质序列，这里介绍使用NCBI数据库来检索蛋白质序列。在NCBI数据库选择“Protein”，同时在检索框中输入要检索的蛋白质如这里的“lactate dehydrogenase trichomonas vaginalis”，为了快速检索到自己需要的蛋白质序列，可以通过蛋白质名称加来源物种。

在检索结果中选择自己需要的条目，如这里可以看到来源于trichomonas vaginalis物种的条目有很多，这个时候可以选择一个即可，这里选择的是没有配体的蛋白质。进入条目之后就可以通过FASTA打开FASTA格式的氨基酸序列。

在新打开的页面可以看到FASTA各式的文件，通过以上方式就可以查询到特定的蛋白质的氨基酸序列，可以复制该氨基酸序列到文本文件备用。

通过NCBI数据库可以查询特定蛋白质的氨基酸序列，如果不喜欢通过也以上的方式查询则可以通过自己喜欢的方式去查询氨基酸序列。