1..功能优势之-采集后荧光补偿 （Kaluza 也可以！）
BD公司的CellQuest,不具备这个功能。

所谓 采集后补偿及在采集了实验数据和单染样品 之后,再在软件里进行荧光的补偿调节。

很 多人倾向于在数据采集的时候进行荧光补偿,并错误的认为那才是最正确的补偿方式,其实这是一种非常错误的认识。

在模拟 信号的机器上的荧光补偿很多时候是目测为 准,及大家都尊从的”横平竖直“的标准。目测调整荧光条件可能会导致巨大的误差而不自知。

正确的方法是：用方程式去计算阳性和阴性细胞群的荧光强度中位数值(MFI, median fluorescence intensity),从而得到最佳的补偿条件。

Diva软件提供软件的自动计算功能,但是却不能轻松的进行补偿后的调整。

Flow Jo 同时具备自动计算和补偿后的再调节。在FlowJo 里,你也可以再次的对你的补偿条件进行微调,再也不用因为补偿出错而懊恼了。

2.功能优势之-贴心功能设计
✦FlowJo里你可以自定义门的名称,如命 名门为”淋巴门”, “FoxP3阳性门” 或者英文 的”lymphocytes”, “FoxP3+cells”等等。各个 门不再是干巴巴的代号,而是有血有肉的精 确命名的细胞群。
✦图片的叠加,FlowJo 图片叠加功能非常 好用,只需将2个图片拖在一起即可。而其它的软件则可能需要很复杂的步骤才可以办到或者是根本没有这个功能。叠加的图片还可 以制作成立体的三维图。
✦直接将数据导出到Excel文件! FlowJo 可以很轻松的将数据导出到Excel文件,省去了很多抄写的麻烦。
✦3D 视图
✦动画数据导出。你可以将图片数据以动 画的形式导出为一个动态电影。

3.功能优势之-强大的分析功能设计
你知道什么是数据联接吗(Concatenate)? 顾名思义,就是将2个或者2个以上的FCS数据,整合为一个FCS数据。这个数据联接功能在以下情况下,可以帮你解决燃眉之急或者将你的数据分析提高到一个新的档次
✦同一管样品,不小心分2次采集,生成了 2个FCS数据。如果你要分析的是表达量很低的细胞群,单个FCS数据细胞总数不够的情况下,你可以利用数据联接的功能将之合并 为一个数据。
✦在抗体滴定实验,或者是样品不同时间 点的药物处理及其它涉及到实验中样品只有一个处理条件有变,其余参数均不变的情况下,可以将不同的数据联接为一个,并将所 有数据点图呈现在一个图像窗口里,从而观察随着条件的变化,细胞抗体表达的渐变过程。

源自科学网张千君博客