在实际操作上，单一窗口在以下三个层面有所区别：1）范围，即参与机构和其他利益相关方，包含的规程和流程，提供的服务和功能。2）操作模型和管理结构。3）技术架构。

1 范围

通常情况下，有三种类型的服务和功能已经集成到现有的单一窗口中，包括传统的海关清关功能，一般的跨境交易需求处理，以及运输和物流相关的功能。一个新的发展动向是向与支付相关的银行服务倾斜。最近开发的单一窗口倾向于涵盖所有这三种类型的服务。从参与机构来说，以海关为中心的单一窗口为了货物清关而在贸易商和海关之间提供联接，但却并不将服务扩展到其他政府机构的规程中。还有的单一窗口为其他政府机构的规程提供单入口点，但是却要求贸易商独立地承担海关清关；有的国家单一窗口通过建立与海关清关的联接来合并其他政府机构的规程。

2 操作模型

UN/CEFACT和WCO发布的单一窗口实施的国家经验和案例研究表明，在操作模型和治理结构方面有所区别。单一窗口可以完全民营化（德国和危地马拉），或者由公私合作的合伙企业来运作（塞内加尔），或以公共部门模式来运行（芬兰，美国和瑞典），也可以围绕海关当局（一个独立的单一窗口实体）或者某一个体来构建。它所能提供的服务可以是免费的，或者以不同的付款方式向用户索要费用（塞内加尔，德国）。

3 技术架构

技术架构可以是一个集成模型，其中由一个系统来处理数据的提交和数据处理；也可以是一个接口模型，其中单一窗口作为网关服务器，通过接口给代理机构的操作系统提供信息；或者是一个混合模型。尽管UN/CEFACT发布的建设书33号中仍然提到不依赖与信息和通讯技术建立物理单一窗口的可能性，但是单一窗口概念的演进却显示：从实用性上来讲，今天建立单一窗口主要依赖的就是信息和通讯技术以及互联网技术。

4标准和工具

有许多标准和工具都为国际贸易单一窗口提供了法律、管理和技术框架方面的支持。UNECE的建议书及其指南是第一个详细的参考资料，他们涵盖的内容包括：

●UN/CEFACT关于建立单一窗口的建议书及其指南（建议书33号）；

●UN/CEFACT关于国际贸易数据简化和标准化的建议书（建议书34号）；

●UN/CEFACT关于建立国际单一窗口的法律框架的建议书（建议书35号）；

●UN/CEFACT关于单一窗口应用的知识库。

    UN/CEFACT和联合国亚太经济社会委员会（UNESCAP）为单一窗口的实施发布了许多指南。其他组织也正在致力于该领域的研究，包括世界海关组织（WCO）已经发布纲要来阐述如何建立单一窗口环境，此外“国际贸易便利化实施指南”网站也在单一窗口栏目提出了许多案例研究资料。海关数据自动化系统（ASYCUDA）是UNCTAD的一个项目，它为单一窗口环境提供技术平台，涵盖了关键的对外贸易规程。