DOGMA 是专门针对植物叶绿体和动物线粒体的在线基因注释网站

（http://dogma.ccbb.utexas.edu/）

进入DOGMA网站

http://s2/bmiddle/00688QPyzy6ZAoODwRPf1&690

step2:

填写step1注册的Userid，及其他信息，参数默认；

输入文件为组装完成的基因组，注意：DOGAM只接受一条序列输入，所以该叶绿体或线粒体应该是完整的一条基因组序列，如果基因组是多个contig组成的，那么只能一次一条的输入。不过一般而言，细胞器基因组并不大，所以拿到的基本上都是完整的基因组。

 step3:

输入Userid

http://s9/mw690/00688QPyzy6ZApjFLx608&690

进入Retrieve Annotation界面，点veiw查看

http://s14/bmiddle/00688QPyzy6ZApnJQND3d&690

1, 点“Text Summary”获得gene的位置信息

http://s2/bmiddle/00688QPyzy6ZApt7O2541&690

点“Plain Text Summary”下载文本格式文件，（无法直接下载，复制粘贴吧！）

2, 点“Extract Sequences”

http://s16/bmiddle/00688QPyzy6ZApvo6V97f&690

点Protein coding aa sequences和Protein coding nt sequences，下载蛋白和基因序列文件（复制粘贴）得到编码基因和蛋白序列