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不懂编程的你还在瞎搞TCGA、SEER数据挖掘,这里有一个不用任何编程的数据库等着你挖掘呢

(2018-04-05 09:59:58)
分类: 生信

不懂编程的你还在瞎搞TCGA、SEER数据挖掘,这里有一个不用任何编程的数据库等着你挖掘呢, 这到达是什么数据库呢?下面由SCI狂人团队来告诉你答案。




相比于GEO、TCGA、SEER数据,Oncomine数据不需要任何编程,只要你会点鼠标就能完成所有操作,发一篇SCI。大家可以想一想,做GEO、TCGA、SEER,必须会R,此外还要会Perl或者Python, 学习好这些编程要2-3年,如果你要急着发一篇SCI毕业,或者发一篇SCI评职称,等学好编程再来写文章,那时候可能就改朝换代了。Oncomine真的有这么神奇吗?没有错,它就是这么神奇。




Oncomine是什么?

Oncomine是大型肿瘤基因芯片数据库,涵盖65个基因芯片数据集、4700个芯片及4亿8千万个基因表达数据,可用于分析基因表达差异、寻找离群值、预测共表达基因等,并可根据肿瘤分期、分级、组织类型等临床信息进行分类,还可依据已知的基因—药物分析寻找可能的分子标记物与治疗靶点。


https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/pJ9kzvDkbIfn61czoTQzRDrr9laDsSrxoibb7FibnRZYhhpkJzxbZia7jsB0kafaHRZYgtjD5E9AE2180CepDtv3Q/640?wx_fmt=png&tp=webp&wxfrom=5&wx_lazy=1


Oncomine有什么?

Oncomine囊括了19种癌症基因芯片数据,含有715个数据集,86733个样本,各样各样的分析。


https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/pJ9kzvDkbIfn61czoTQzRDrr9laDsSrx208vTeaFg2hnENdDdIVszCaCXG0xphoeib3JqPsZAA2aQjibyQJZDF9w/640?wx_fmt=png&tp=webp&wxfrom=5&wx_lazy=1


Oncomine能做什么呢?

基因差异表达分析

   基因拷贝数变异分析

Meta分析

基因表达与临床相关性

基因共表达分析

Outlier分析

Concept分析

......


不做实验,只挖这个Oncomine能发SCI吗?

没有错,不用做实验只挖Oncomine完全可以发SCI。


学习Oncomine真的不用学习编程吗?

对的,做Oncomine数据挖掘不用任何编程,只需要你会点鼠标就足够了。

论文成果展示:

http://s9/mw690/005SshKjzy7jrNE43e8f8&690


http://s4/mw690/005SshKjzy7jrNDYqAje3&690

http://s8/mw690/005SshKjzy7jrNE5Y2P17&690

http://s8/mw690/005SshKjzy7jrNEnumPe7&690

http://s13/mw690/005SshKjzy7jrNEfeY4ec&690


https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/pJ9kzvDkbIfn61czoTQzRDrr9laDsSrxpoofn1DvGscPwCukDKwcWqVCB7tIIk1Bk7HtHw4q4orxkFGAycbVKg/640?wx_fmt=png

https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/pJ9kzvDkbIfn61czoTQzRDrr9laDsSrxkoXRE7lUicclDJLibvqFibwkAK7ag6UiaxLy36iaicnMlvLmybaKicibMjCe0Q/640?wx_fmt=png

https://mmbiz.qpic.cn/mmbiz_png/pJ9kzvDkbIfn61czoTQzRDrr9laDsSrx3XqIgFJdbV2Pow7Vdw1mapVLfCHuzMBm5MQlrnRnaggMMck6wqnwiag/640?wx_fmt=png


 





问题来了,学习Oncomine数据挖掘有没有捷径呢?答案是有的。那捷径在哪里呢?大家点开阅读原文就可以找到了捷径

阅读原文

 

SCI狂人团队

 

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