古DNA数据表明5000年以前老欧洲人父系主要是C和I (2017-08-08 15:47:57)转载▼

遗传谱系开源工具网站列出了很多欧洲的古DNA，不仅证明了CF平级和迁徙伴随性，而且证明了5000年前老欧洲人父系主要是C和I。5000年以前欧洲古DNA父系4个C，4个I，甚至母系mt-U很可能是Y-C最早主要“原配”。（Genetic Genealogy Tools: Ancient DNA  http://www.y-str.org/p/ancient-dna.html）。目前仍然没有一例古DNA能证明C系是老亚洲。东亚大陆主要是C3系，爆发时间可能不到3000年。笔者一个最新推测东亚地区C3很可能是欧洲方向C*伴随斯基泰人向东亚方向扩张爆发的。今天欧洲人主要父系R1b和R1a源于4000多年前黑海北草原雅利安人的扩张，而3~4万年前古DNA表明，R系祖先在西伯利亚。R和C古今正好反了过来？

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Sample Name	Sample Location	GEDMatch	Sex	Y-DNA	Mt-DNA	Approx. Age by authors	My Analysis or Comments
Altai Neanderthal	Denisova Cave, Siberia	F999902	F			50,000 years
Denisova	Denisova Cave, Siberia	F999903	F			30,000 years
Palaeo-Eskimo	Qeqertarsuaq, Greenland	F999906	M	Q1a	D2a1	4,000 years	Palaeo-Eskimo 2000 BC DNA
Clovis-Anzick-1	Montana, North America	F999919	M	Q-Z780	D4h3a	12,500 years	Matches Living people.
Mal’ta	South - Central Siberia	F999914	M	R	U	24,000 years	Matches Living people on X Chromosome.
La Braña-Arintero	León, Spain 西班牙	F999915	M	C-V183	U5b2c1	7,000 years	Analyzing La Braña-Arintero Ancient DNA
Motala-12	Östergötland, Sweden	F999917	M	I-L460	U2e1	7,000 years	My Analysis of Motala-12 ancient DNA
LBK	Stuttgart, Germany	F999916	F		T2c2	7,500 years	Matches Living people
Loschbour	Loschbour, Luxembourg	F999918	M	I-L460	U5b1a	8,000 years	Matches Living people
Ajvide58	Sweden	F999924	M	I-CTS772	U4d	5000 years	Ajvide58 DNA Analysis
Gökhem2	Sweden	F999934	F		H1c	5000 years	Gökhem2 Ancient DNA Analysis
Hinxton-2	Cambridgshire, UK	F999921	F		H2a2b1	1300 years	Hinxton-2 Analysis
Hinxton-3	Cambridgshire, UK	F999922	F		K1a4a1a2b	1300 years	Hinxton-3 Analysis
Hinxton-4	Cambridgshire, UK	F999925	M	R-DF25	H1ag1	2000 years	Hinxton-4 has X-Matches with living people
Hinxton-5	Cambridgshire, UK	F999926	F		H2a2a1	1300 years	Hinxton5 Ancient DNA Analysis
KO1	Tiszaszőlős-Domaháza, Hungary	F999931	M	I-L68	R3	5650-5780 cal BC	Analysis of Neolithic KO1 genome
NE1	Polgár-Ferenci-hát, Hungary	F999937	F		U5b2c	5070-5310 cal BC	Ancient NE1 Matches living people
NE5	Kompolt - Kigyósér, Hungary 匈牙利	F999927	M	C-F3393	J1c	4990-5210 cal BC	Ancient Hungarian Genome NE5 Analysis
NE6	Apc-Berekalja I., Hungary 匈牙利	F999932	M	C-P255	K1a3a3	4950-5300 cal BC	Analysis of Hungarian genome-NE6
NE7	Apc-Berekalja I., Hungary	F999928	M	I-L1228	N1a	4360-4490 cal BC	Ancient Hungarian genome - NE7
CO1	Apc-Berekalja I., Hungary	F999930	F		H	2700-2900 cal BC	Analysis of Copper age genome CO1
BR2	Ludas-Varjú-dűlő, Hungary	F999933	M	J-M67	K1a1a	1110-1270 cal  BC	Ancient BR2 matches living people
IR1	Ludas-Varjú-dűlő, Hungary	F999929	M	N-M231	G2a1	830-980 cal BC	Ancient Hungarian genome - IR1
Ust'-Ishim	Ust'-Ishim, Siberia	F999935	M	K-M526	R	45,000 years	Ust'-Ishim matches with living people!
Kostenki14	European Russia 欧洲部分俄罗斯	F999936	M	C-V199	U2	38,700-36,200 years	Kostenki14 Ancient DNA Analysis
RISE00	Sope, Estonia	F999955	F		H5a1	~2000 years
RISE94	Viby, Sweden	F999956	M	K-M1221	K1a2a	4025 years	RISE94 has matches with living people
RISE97	Fredriksberg, Sweden	F999945		CT-Y1580	K2a5	3590 years
RISE98	L Beddinge 56, Sweden	F999941	M	R-M405	K1b1a	3736 years	RISE98 has matches with living people
RISE150	Przeclawice, Poland	F999948			U5a1b1	3469 years	RISE150 has matches with living people
RISE174	Oxie 7, Sweden	F999943			W1	1521 years	RISE174 has matches with living people
RISE395	Bol'shekaraganskii, Russia	F999949	F		U2e1	3540 years	RISE395 has matches with living people
RISE479	Erd 4, Hungary	F999944	M	I-L1228	T2b	~2000 years
RISE493	Sabinka 2, Russia	F999950	M	Q-L712	C4a1c	3214 years	RISE493 has matches with living people
RISE495	Arban 1, Russia	F999958	M	R-F3105	D4j1
RISE496	Arban 1, Russia	F999959	F		U5a1a2a	3070 years
RISE497	Arban 1, Russia	F999957		F-P142	A2f2	~2000 years	RISE497 has matches with living people
RISE499	Bystrovka, Russia	F999952	F		H5a1	~2000 years
RISE500	Kytmanovo, Russia	F999947	F		U4d1	~2000 years
RISE502	Bystrovka, Russia	F999960	F		U5a1d	3140 years
RISE503	Kytmanovo, Russia	F999961			U2e2	3328 years
RISE504	Kytmanovo, Russia	F999962	M	J-CTS3732	C4a1d	1208 years
RISE505	Kytmanovo, Russia	F999953			U4a1b	3391 years	RISE505 has matches with living people
RISE509	Bateni, Russia	F999942	F		T2c	4186 years
RISE511	Bateni, Russia	F999967	F		J2a2a	4224 years
RISE523	Kapova cave, Russia	F999966			G2a1	3192 years
RISE548	Temrta IV, Russia	F999968	M	R-L23	U4	~2000 years
RISE552	Ulan IV, Russia	F999946	M	I-S12195	T2a1a	3940 years	RISE552 has matches with living people
RISE569	Brandysek, Czech Republic	F999954			H1af2	~2000 years
RISE577	Velke Prilepy, Czech Republic	F999951			T2b	~2000 years
RISE601	Verh-Uimon, Russia	F999969	M		M8a1	~2000 years
RISE602	Sary-Bel, Russia	F999965	M	J-M410	C4	~2000 years
Bot15	Rio Doce, Minas Gerais, Brazil	F999963	M	C-PH3092	B4a1a1a	~1600 AD
Bot17	Rio Doce, Minas Gerais, Brazil	F999964	M	C-Z31878	B4a1a1	~1600 AD
Kennewick Man	Kennewick, Washington state, USA	F999970	M	Q-M199	X2a	8358 years

转发《常染色体所见的东南亚人群以及“澳美人种”来源问题》

 

 

 

 

最有意思的是东南亚部分：作者认为negrito起源于中南半岛，经过印尼北部然后再北上菲律宾的（印尼西部的negrito成分也很高）；南亚成分/美拉尼西亚成分也起源于中南半岛；而南岛人起源于台湾一路南下，在很多民族中都有高频分布；巽他海峡是一个重要分界线，以东有大量美拉尼西亚成分，以西则是南亚成分的高频区域。

http://download.springer.com/static/pdf/46/art:10.1186/s13323-015-0024-0.pdf?originUrl=http://investigativegenetics.biomedcentral.com/article/10.1186/s13323-015-0024-0&token2=exp=1477126797~acl=/static/pdf/46/art%3A10.1186%2Fs13323-015-0024-0.pdf*~hmac=af99f69a1080870a1226a23e222667fe5210b5d9bef1494e713476b1e8d7bf91

同时对于亚美人种也做了分析。

内部关系也是很复杂的，与汉族最相近的是北美北部的Chipewyan族群。

 

与汉族关系最远的是中美洲Zepotc和南美洲的Karitiana，分开已经N多年了。。。还有研究显示karitiana还和澳洲土著有混血？（维基百科A 2015 research paper showed that the Karitiana, along with other indigenous peoples of the Amazon, have partial genetic ancestry from indigenous Australasians.[7]比较有意思的是因纽特人和同属于因纽特人的东西伯利亚（近白令海峡）的Naukan人，其实这群人的主体血缘也和汉族分离很久了，但是其形成之初就有与chipewyan的43%共祖血统，并且Naukan与大多数inuit人的差异在于其与汉族有近期的一小部分混血。。。

 

本帖最后由 imvivi001 于 2016-10-22 23:15 编辑

 

 

 

 

这张图应该存在问题，把汉族这个血统混杂同时形成历史相对比较晚近的超级民族，与Chipewyan、Zepotc、Karitiana、Naukan、chipewyan、inuit这些人口稀少相对比较纯粹的族群放到同一颗发生树做比较显然是不合适的，比较合理的方法是做常染的PCA或MDS比较分析才可以比较准确地看出相互之间的距离。

 

看Mathieson、 Lazaridis、赖希团队去年的Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians一文提到，在八千年前的瑞典motala古人中，六个样本居然发现3个有370a变异，难道现代意义上的东亚人这么早就殖民去了北欧？ 目前暂时没查到这些人的y-snp。

 

根据文中，这些明显带有东亚血统的瑞典古人，同时也携带现代北欧人的特色变异（比如浅色眼眸与浅肤色），母系是欧洲北部常见的mtU5支系，应该是一个混血族群。不过目前欧洲方面的公开报道仅提及他们当中的y有一例y-I2与一例I2a（红发白肤），其他y类型则未见报道，感觉欧洲学者有一种讳莫如深的感觉，结合现在欧洲分子人类学论坛上许多欧洲坛友对自身东亚血统极力撇清的种族主义倾向态度，因此我有理由猜测其他的y类型极有可能是y-N1c 即早期的乌拉尔语系人群。

    说起欧洲人的东亚血统，最早的可以追溯到罗马尼亚境内与尼人严重混血的oase古人（y属于FxGHIJ，常染与现代欧亚人群比对更接近东亚人，不出意外的话应该是与乌斯季辛古人很接近的某已经灭绝的K2a支系，不知道为何欧洲学者未做具体的下游检测，或者是已经检测但是出于某种不为人知的情绪没有公开）。之后，第二批大举进军欧洲的东欧亚人群应该就是欧洲的Gravettian文化人群，其y主频是现在欧洲很少见的C-V20，他们带去了当时非常发达的旧石器晚期的细石器工业与西伯利亚艺术（目前C-V20在西伯利亚几乎完全缺失，而他们的近亲C1a1却出现在日本，个中缘由耐人寻味）。 第三批大举进军欧洲的应该就是北亚乌拉尔人（目前检测结果显示，乌拉尔人进军欧洲也是主要分为两批），他们身上的E.E.血统则更为明显。第四批当然就是现在已经揭晓的青铜时期的印欧人，不过目前来看，印欧人身上的E.E.血统并不多。因此，现在在西北欧人群身上检测到的E.E.血统，我估计主要还是来自新石器早期的乌拉尔殖民者，其次则是印欧人带去的很少量的E.E.成分（我的现在看法，初始印欧人的E.E.应该有5%，但是在西进的过程中不断地与当地西欧亚人群混合，到了欧洲之后其E.E.成分已经大大地稀释了）。

 

罗马尼亚的oase古人可追溯到37kya，比利时的C1a样本要比oase晚两三千年。不过我还是认为包括C1a，I，K2a，C1b在内的单倍群都是从43000年前左右开始第一批进入欧洲的现代人，可能在进入时间及路线上会有差别。

 

http://s1/mw690/005OOLMVzy7f9FYkzzad0&690》" TITLE="转发《古DNA数据表明5000年以前老欧洲人父系主要是C和I 》" />

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顺便说一下，乌斯季伊施姆的母系也和田园洞一样是PRE-B,欧洲的OASE在系统树上也和NO更近，但比乌斯季伊施姆更早分化出来。

 

链接已经给出了乌斯季辛古人和K2a共享的位点。

 

We identified the haplogroup for each Y chromosome using the mutations described in the Y-DNA Haplogroup Tree (Y-DNA Haplogroup tree 2013 in]http://www.isogg.org/tree ;.  The Ust’-Ishim Y chromosome sequence clusters with the K(xLT) haplogroup.

 

你如果看不懂这个，还说什么，我给的链接已经给出了其和K2a共享的位点

sahaliyan 发表于 2016-10-31 11:47

 

你引用的红线部分只是说乌斯季辛古人属于K2，这个我上面的帖子已经标示了，不知道你想反驳什么？

 

10-30-2014, 09:54 AM #24

lgmayka  lgmayka

 

 

10-30-2014, 09:54 AM #24

lgmayka  lgmayka

 

G. Magoon just announced this on a mailing list:

---

I've just been taking a look at the chrY data for the ancient genome described here:http://www.nature.com/nature/journal...ture13810.html (data just became available today). The authors of the paper classify him as K(xLT), but that is based on an older tree. I've been looking at the results in the context of our tree and a preliminary look suggests that this will split the SNPs we have as defining "Hg-X" into two levels. In particular, his results suggest he is:

CTS11667+

Z4842/M2308+

Z12216-

Z4845/M2313-

Z12176-

Z4952/M2339-

 

F650/M2346-

---

 

On YFull's haplotree, then, this man from 45,000 years ago has some but not all of the SNPs associated with K-M2335, which is essentially pre-NO.

 

仔细看看这个，还要多说什么吗

请特别注意你这里引用的G. Magoon 所犯的错误，显然他没有搞清楚F650/M2346与现在K2a的等位关系，不过考虑到当年他不可能知道现在的Y发生树的变化情有可原，但是你一个本坛老会员兼高级会员，人云亦云再犯这样的简单错误则太不应该了。那帖子下已经明确了这个是K2a2，而乌斯季伊施姆相对其他K2和NO共享一系列SNP，可以定义K2a，脑子没坏的都能看出来。那个两年前的“古代坛友”所犯的错误，难不成就成了今天的你原版照抄变身正确的依据？

 

 

菲律宾尼格利托和巴布亚人是同一支系。