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微生物分类是按微生物亲缘关系把微生物归入各分类单元或分类群 (taxon)，以得到一个反映微生物进化的自然分类系统、可供鉴定用的检索表以及可给出符合逻辑的名称的命名系统。

微生物分类学(microbial taxonomy)：研究微生物分类理论和技术方法的学科。具体任务有三，即分类(classification)、命名(nomenclature)和鉴定(identification)。　

分类指的是根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个分类单元中；

命名是按照国际命名法规给有机体一个科学名称；

鉴定则是确定一个新的分离物是否归属于已经命名的分类单元的过程。

第一节 微生物的分类

生态学 (ecology)，是一门研究生命系统与其环境系统间相互作用规律的科学。

微生物生态学(microbial ecology)，研究微生物与其周围生物和非生物环境条件间相互作用规律的科学。

第一节 微生物在自然界中的分布与菌种资源的开发

自学内容：

1. 了解微生物在土壤、水体、空气、工农业产品、极端环境及生物体内外的分布概况；

2.. 熟悉水体自净作用；饮用水的微生物学标准及采用大肠菌群作为检测指标的原理；不同嗜极菌的特点及其应用；

3. 掌握

第三节 基因重组和杂交育种

基因重组，又称

遗传（heredity）：亲代将自身的一整套遗传物质传递给子代的行为或功能。

变异（variation）：生物体在某种内因或外因的作用下，发生遗传物质的结构或数量的改变。

遗传型（genotype）：又称基因型，指某一生物所含有的全部遗传因子即基因组所携带的遗传信息。 

表型（phenotype）：某一生物所具有的一切外表特征和内在特性的总和，是其遗传型在一定的环境条件下通过代谢发育而得到的具体体现。

饰变（modification）：发生在转录、转译水平上的表型变化，并不涉及遗传物质的改变。特点是整个群体中的几乎所有个体都发生同样的变化；因遗传物质未变，故饰变是不遗传的

第五节有害微生物的控制

第三节影响微生物生长的主要因素 

一 温度(temperature)

生长温度三基点：最低、最高、最适温度。

最适生长温度：细胞迅速生长繁殖的温度，即代时（G）最短或生长速率常数（R）最大时的培养温度。

根据微生物生长温度范围，通常把微生物分为嗜热型、嗜温型和嗜冷型三大类。

二 氧气(oxygen)

1.按微生物对氧的不同需求与影响，把微生物分成5种类型

① 专性好氧菌  具有完整的呼吸链，以分子氧作为最终电子受体，只能在较高浓度分子氧（～0.2巴)，相当于正常大气中的氧分压）条件下才能生长，大多数细菌、放线菌和真菌是专性好氧菌。如醋杆菌属、固氮菌属等。

② 兼性厌氧菌

除特定目的外，在微生物研究和应用中，只有群体生长才有实际意义，因此，在微生物学中，“生长”一般指群体生长。

第一节 

第一节     微生物的能量代谢

生物氧化，发生在活细胞内的一系列产能性氧化反应的总称。

三种形式：某物质与氧结合、