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分类: 生活感悟

124日,到三亚的第一个早晨,躺在床上想睡个懒觉,收到殷平老师发来的一个截屏,是自然杂志刚刚在线发表的一篇文章,有关玉米单倍体基因克隆(http://www.nature.com/nature/journal/v542/n7639/full/nature20827.html)。这是我过去几年来特别关注的一个领域,和中国农大金老师和陈老师的合作项目。翻到基因号,和我给殷平老师合作做结构和功能的候选基因是同一个,起作用的方式也一模一样,4bp插入,殷平老师了回了一个字“这!”。怎么办?我当时脑袋一片空白,郁闷可想而知。殷平老师建议,尽快给Mol Plant一个letter

和崔晓峰主编打了一个电话,说了一下原委,崔主编很痛快,欢迎我们尽快投稿。我立即 和学生和合作伙伴们电话,把文章一一发给他们。24号晚,在路

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标签:

杂谈

分类: 生活感悟

上周回到高中母校崇阳一中为学弟学妹做了一场励志报告。感触颇深:现在的高中生比我们当年活跃有思想多了,敢问问题;与在高中教书的老同学相见,很高兴,高中老师不容易,很辛苦!高三班主任就在我到达当天离开我们,未能见上最后一面,一生的遗憾。


尊敬的各位老师,亲爱的各位学弟学妹,

大家好!

崇阳一中是我的母校,也是我构筑梦想的地方,我爱她!25年前,和大家一样,我背着行囊,怀揣着梦想,忐忑不安走进了一中的校园。

华中农业大学也是我的母校,也是我梦想起航的地方,我也爱她!22年前,我一样背着行囊,充满喜悦和新奇走进了华中农大的校园。

今天,我非常高兴,也非常幸运有机会能把这两所学校联系在一起,和各位学弟学妹分享一下我所经历的两个母校,以及母校给予我的不一样的经历。

1992年,我从路口中学考进崇阳一中,那年我是我们班上唯一一个考进一中的学生,全校五个班,我成绩是第四名,心中还是相当得意的。我第一次走出路口,走进了崇阳的县城,看到一中高大的实验大楼,内心觉得特别震撼,因为那是我见到的最漂亮的建筑。高中也是五个班,但高一的第一次全校联考,我的成绩

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(2016-05-26 09:16)
分类: 生活感悟

读了“殷平团队:一群领跑的科研达人”的故事颇有感触 (http://news.hzau.edu.cn/2016/0526/45706.shtml)。和殷平很熟,也很投缘。作物遗传改良国家重点实验室的学术沙龙做到第100期的时候,我请殷平接手,他欣然接受,现在又快做满100期了。他用持续的激情感染着一批又一批的青年学生,人少的时候他就坐在下面暖场,人多的时候,他有时就倚在门框看大家热烈的讨论。我有时候奇怪,他为什么能这么精力充沛而不知疲惫?

王祥是学术沙龙的积极参与者之一,最近的一次学术沙龙是他主持。我见他剪了一个新发型,留的头发很短,就打趣道:这是为了纪念Nature 文章的发表?他机智的回答:不是,是为了主持这次重要的学术沙龙活动。论文补试验是一个非常痛苦的过程,尤其在规定的时间内,王祥也一样,在几乎绝望的时候,他决定去参加武汉马拉松的比赛,花了六个小时跑完全程,然后拖着一条受伤的大腿,直奔实验室通宵试验而毫无倦意。殷平和我起说这细节的时候,对这个学生充满欣赏和敬意。这种意志力恰恰是我们年轻人最需要的一种精神:坚持而永不放弃!

常常有人发问:什么是幸福,这样没日没夜的投

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(2016-03-09 10:25)
分类: 每周推荐

如何利用大数据进行QTL的克隆和分析,是未来的方向。

韩斌老师刚刚NG的文章提供了一个直接的例子!

值得一读!​

OsSPL13 controls grain size in cultivated rice

http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.3518.html


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(2016-01-06 15:56)
分类: 我们的文章

老数据出新篇,最近我们发表了两篇文章都是基于我们已经发表的数据重新分析而来的。

1. 闻玮玮等 基于发表代谢数据(Wen et al, Nature Communications, 2014),对代谢调控网络的新认识。

Combining quantitative genetics approaches with regulatory network analysis to dissect the complex metabolism of the maize kernel​

http://www.plantphysiol.org/content/early/2015/11/10/pp.15.01444.abstract​ 

2. 金敏亮,刘海军,何骋等基于发表的RNA-seq数据 (Fu et al, Nature communicaitons, 2013), 对玉米PAN genome及其对性状影响的新认识。

Maize pan-transcriptome provides novel insights into genome complexity and quantitative trait variation​

http://www.nature.com/articles/srep18936​ 

祝贺各位!​

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(2016-01-01 18:58)
分类: 我们的文章

2015年最后两天,new phytologist  发表了我们的2篇文章。算新年礼物!

这个研究是我还没有回国就开始折腾的一个东西,希望把任意群体放在一起来分析,尽管结果并没有达到预期,但终究是发表出来了,谢谢中国农大和华中农大课题组无数老师学生的共同努力,特别致谢杨小红教授的贡献。

Genome-wide recombination dynamics are associated with phenotypic variation in maize

Qingchun Pan, Lin Li, Xiaohong Yang, Hao Tong, Shutu Xu, Zhigang Li, Weiya Li, Gary J. Muehlbauer, Jiansheng Li and Jianbing Yan

Article first published online: 31 DEC 2015 | DOI: 10.1111/nph.13810

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.13810/abstract 

Genome-wide dissection of the maize ear genetic architecture using multiple populations

Yingjie Xiao, Hao Tong, Xiaohong Yang, Shizhong Xu, Qingchun Pan, Feng Qiao, Mohammad Sharif Raihan, Yun Luo, Haijun Liu, Xuehai Zhang, Ning Yang,

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(2015-12-24 17:31)

水稻的竞争要多惨烈?而同一个基因此前也刚刚发表在Molecualr Plant

Nature Plants 刚刚发表了3篇文章,都是对同一个基因的功能解析。​

1.遗传所 储成才老师组

 Control of grain size and rice yield by GL2-mediated brassinosteroid responses

http://www.nature.com/articles/nplants2015195​ 

2. 遗传所 李云海老师组

Regulation of OsGRF4 by OsmiR396 controls grain size and yield in rice​

http://www.nature.com/articles/nplants2015203

3. 武汉大学 李绍清老师组

Blocking miR396 increases rice yield by shaping inflorescence architecture​

http://www.nature.com/articles/nplants2015196

此前的MP 是来自水稻所的钱前老师组

A Rare Allele of GS2 Enhances Grain Size and Grain Yield in Rice​

http://www.cell.com/molecular-plant/abstract/S

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(2015-11-24 11:14)
分类: 每周推荐

李青的又一篇大作,热点都在题目上了,已经开始超越我的知识范围了!大赞!


RNA-directed DNA methylation enforces boundaries between heterochromatin and euchromatin in the maize genome

  • Qing Li, Jonathan I. Gent, Greg Zynda, Jawon Song, Irina Makarevitch, Cory D. Hirsch, Candice N. Hirsch, R. Kelly Dawe, Thelma F. Madzima, Karen M. McGinnis, Damon Lisch, 
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(2015-09-24 14:39)
标签:

育儿

分类: 每周推荐
秦峰老师的大作,抗旱的自然变异!非常漂亮!

如果抗旱能做如此漂亮的工作,那其它任何性状都应该可以!换一句话说,任何性状都适合关联分析,关键在于你的表型鉴定!

另外一点 comments 是:转座子,转座子的作用比我们想象的大,目前的参考基因组不够,二代测序也不够!

A transposable element in a NAC gene is associated with drought tolerance in maize seedlings

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    (2015-09-15 21:59)
    分类: 每周推荐

    再comment 几句:认真看完了,堪称经典的遗传学分析文章,可以在遗传学课堂上讲相斥连锁的时候用。文章写得也行云流水,通俗易懂。

    余建明老师的大作,给杂种优势的 over dominance (pseudo-overdominance) 提供了一个直接的例子!

    Dissecting repulsion linkage in the dwarfing gene Dw3 region for sorghum plant height provides insights into heterosis

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