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本周推荐(117)(2009-12-05 12:33)

刚刚注意到,我们2008年的一篇文章,被评为2008年中国百篇最具影响国际学术论文。

详细信息在这里:

http://www.sciencenet.cn/upload/blog/file/2009/11/20091127135450319371.pdf

 

其实也是一篇普通的QTL定位文章,不过这篇文章,我认为有2个特点:

1)性状之前报道的很少(维生素a相关)

2)定位了2个主效QTL.

 

希望明年,给大家详细报道这两个QTL涉及的基因以及其生物学和应用的意义。

 

Using molecular markers to identify two major loci controlling carotenoid contents in maize grain

 

期刊 TAG Theoretical and Applied Genetics
出版社 Springer Berlin / Heidelberg
ISSN 0040-5752 (Print)
谁是下任农业部长?(2009-12-02 10:29)
难道传闻就是现实?期待和祝福中...
breaking news(2009-12-02 10:08)

为什么中文媒体没有见报道?

 

看看相关股票涨停没有?

 

EXCLUSIVE - China gives safety approval to GMO rice


A vendor waits for customers at a rice store in Xiangfan, central China's Hubei province, June 28, 2006. REUTERS/Stringer
By Niu Shuping and Tom Miles

BEIJING, Nov 27 (Reuters) - China, the world's largest rice producer and consumer, has approved a locally-developed strain of genetically-modified rice, paving the way for large-scale production in 2 to 3 years, Chinese scientists said on Friday.

The Ministry of Agriculture's Biosafety Committee has issued biosafety certificates to Bt rice, a pest-resistant genetically modified strain, two committee members told Reuters.

Along with GM phytase corn approval announced last

瞬间(2009-12-02 04:26)

在华农北美校友网上看到这个原创的MV,熟悉而漂亮的华农校园勾起我无限的遐想。

 

在草丛或者水稻田边,偎依着心仪的女孩,谈着吉他;那肯定是大学生活最美丽的时光,尽管,音乐一直是我最短最短的短板,但无法我阻止我取遐想。。。

 

作词: 陈 梦(华中农业大学)
作曲: 叶小文(华中农业大学)
编曲: 王子昆(华中农业大学)
演唱: 钱雨果(华中农业大学)

艺术指导:郑鲁成(武汉理工大学)
导演: 林 江(华中农业大学)
摄影: 王鹏飞(武汉理工大学)
副导演: 孟洪飞(华中农业大学)
演员: 王馨然(华中农业大学)
许 胜(华中农业大学)

 

http://v.youku.com/v_show/id_XNTI1NjQ0NzY=.html

本周推荐(116)(2009-11-28 01:05)

杂种优势是研究的热点也是难点,100年的话题,仍然是不知道的多过知道的。

 

今年9月,德国专门有一个杂种优势的国际研讨会,然后TAG杂志推出了一个专辑,从不同层次和角度探讨这个问题。

 

我们这篇文章,也作为专辑的一篇,文章的写作,久经折腾,最后版本,面目全非了。确实,单纯从遗传学的模型去回答这个复杂问题不容易,也不是我们的长项,这个更多是智慧人的智力游戏。

 

Dissection of the genetic basis of heterosis in an elite maize hybrid
by QTL mapping in an immortalized F2 population


Jihua Tang • Jianbing Yan • Xiqing Ma • Wentao Teng •
Weiren Wu • Jingrui Dai • Baldev S. Dhillon •
Albrecht E. Melchinger • Jiansheng Li

 

Theor Appl Genet
DOI 10.1007/s00122-009-1213-0

 

全文在公共信箱!

 

这个工作费了汤老师费了很大的力气,张启发老师也有些期待,也是他梦想的一部分,问过好几次,最后得知我们发在这个杂志,他说,你们

标  题: 第三代测序技术简介
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Nov 23 00:41:03 2009, 美东)

如果有人告诉你用显微镜实时观测单分子DNA聚合酶复制DNA,并用它来测序,你一定会
认为他异想天开,没有一点生物的sense。
我最初就是这样认为的,然而它不仅可以实现,而且已经实现了!这个就是被称为第三
代的测序技术,Pacific Biosciences公司推出的“Single Molecule Real Time (SMRT
™) DNA Sequencing”(单分子实时DNA测序)。
我有幸在NIH听到了这个技术发明人Stephen Turner博士的讲座,根据自己粗浅的理解
记录整理一下。

要实现单分子实时测序,有三个关键的技术。
第一个是荧光标记的脱氧核苷酸。显微镜现在再厉害,也不可能真的实时看到“单分子
”。但是它可以实时记录荧光的强度变化。当荧光标记的脱氧核苷酸被掺入DNA链的时
候,它的荧光就同时能在DNA链上探测到。当它与DNA链形成化学键的时候,它的荧光基
团就被DNA聚合酶切除,荧光消失。这种荧光标记的

今天本来有更重要的事情要做,但还是忍不住把玉米基因测序在SCIENCE上的4篇相关文章和一篇评论读了一遍,而PLOS GENETICS上的10篇相关文章,还一下子不能读完,只是对其中的一篇特别感兴趣,稍微读了一下。

 

刚刚看到科学网关于玉米基因组测序的报道,可以用4个字来形容,“惨不忍睹”(http://www.sciencenet.cn/htmlnews/2009/11/225368.shtm),科学报道中通常犯的一个错误就是,无限拔高有限结果的意义,而吸引公众的眼球。这篇报道在犯了这个错误的同时,有些翻译也是比较勉强,让内行人也读不懂。

 

其实要感慨的不是这个,感慨的是测序(文章中提到的BAC-BAC,454或者Solexa),这些技术本身已经没有什么新意,基本是一个体力活,但如何把体力活干的漂亮,而且有新意,确是非常professional的事情。中国的测序能力,不说世界第一,至少也是排名前几位的,恰好中国政府也不差钱,所以也常常能在science,nature或所谓顶级杂志上灌灌水,今年已经灌个几回了,最近的一次是nature genetics黄瓜基因组的测序。

 

这些工作重要不重要?

本周推荐(115)(2009-11-20 22:38)

Science, 玉米特辑!(同期PNAS和plant physio.都有相关的文章,估计总数超过20了)

 

应该是玉米届的大事,玉米B73基因组千呼万唤始出来!这期的SCIENCE还包括另外3篇与玉米有关的文章和一片评论。

1)墨西哥的一个当地玉米的测序

2)玉米的第一代HAPMAP

3)玉米杂种优势的转录水平解释!

 

Schnable 是最大的赢家,当然ED名字再次闪亮!

 

刚刚注意到,许多关于某从美国回来的博士,露宿北京街头的报道。真实感觉了这个只为博眼球的媒体的良心。始作俑者是北京电视台。

 

我们最应该关注的应该是一个病人,而不是关注留美博士的光环,对于一个精神病人炒作的结果是,让他更难回到现实生活。作为三个孩子的父亲(一个5岁,一个1岁的双胞胎),我想他清醒的时候比不清醒的时候更痛苦。

 

首先报道这个事情的北京电视台,为了收视率,率先报道了这个事情,我无法看到这个视频,但从一片骂声中,我以为,如果真的是一个有良心和责任心的媒体,应该是想办法去帮助治病,而不是大张旗鼓去博人眼球。

 

清醒的时候,我想这个博士的工作能力不会比我们的大部分差,所以他不需要同情和怜悯,但需要我们文明社会的尊重,需要人文的关怀。

 

这当然是一个个案,我希望社会尤其我们和谐的政府更应该和谐处理这个个案。向在为此事努力的几位好人致敬!

本周推荐(114)(2009-11-17 04:06)

我们试图利用比较克隆结合关联分析的办法来分析水稻的一些重要基因在玉米中的功能。我们开始这个工作很多年以前,但结果并不如人意,这篇文章算是其中的一个例子。

 

尽管结果不是那么振奋人心,但经验教训却在:

1)我们过去可能高估了比较基因组的作用;即便在微线性水平,即以你的位置和内容一致,但功能可能并不一样;

2)复杂数量性状的关联分析,仍然是未知多于已知,我们需要更多点思考。

3)每个物种,我们都应当认为是模式物种,这点最近才领悟到。

全文放在公共信箱

 

Cloning and characterization of a putative GS3 ortholog involved in maize kernel development

 

期刊 TAG Theoretical and Applied Genetics
出版社 Springer Berlin / Heidelberg
ISSN 0040-5752 (Print) 1432-2242 (Online)