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(2016-05-26 09:16)
分类: 生活感悟

读了“殷平团队:一群领跑的科研达人”的故事颇有感触 (http://news.hzau.edu.cn/2016/0526/45706.shtml)。和殷平很熟,也很投缘。作物遗传改良国家重点实验室的学术沙龙做到第100期的时候,我请殷平接手,他欣然接受,现在又快做满100期了。他用持续的激情感染着一批又一批的青年学生,人少的时候他就坐在下面暖场,人多的时候,他有时就倚在门框看大家热烈的讨论。我有时候奇怪,他为什么能这么精力充沛而不知疲惫?

王祥是学术沙龙的积极参与者之一,最近的一次学术沙龙是他主持。我见他剪了一个新发型,留的头发很短,就打趣道:这是为了纪念Nature 文章的发表?他机智的回答:不是,是为了主持这次重要的学术沙龙活动。论文补试验是一个非常痛苦的过程,尤其在规定的时间内,王祥也一样,在几乎绝望的时候,他决定去参加武汉马拉松的比赛,花了六个小时跑完全程,然后拖着一条受伤的大腿,直奔实验室通宵试验而毫无倦意。殷平和我起说这细节的时候,对这个学生充满欣赏和敬意。这种意志力恰恰是我们年轻人最需要的一种精神:坚持而永不放弃!

常常有人发问:什么是幸福,这样没日没夜的投

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(2016-03-09 10:25)
分类: 每周推荐

如何利用大数据进行QTL的克隆和分析,是未来的方向。

韩斌老师刚刚NG的文章提供了一个直接的例子!

值得一读!​

OsSPL13 controls grain size in cultivated rice

http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.3518.html


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(2016-01-06 15:56)
分类: 我们的文章

老数据出新篇,最近我们发表了两篇文章都是基于我们已经发表的数据重新分析而来的。

1. 闻玮玮等 基于发表代谢数据(Wen et al, Nature Communications, 2014),对代谢调控网络的新认识。

Combining quantitative genetics approaches with regulatory network analysis to dissect the complex metabolism of the maize kernel​

http://www.plantphysiol.org/content/early/2015/11/10/pp.15.01444.abstract​ 

2. 金敏亮,刘海军,何骋等基于发表的RNA-seq数据 (Fu et al, Nature communicaitons, 2013), 对玉米PAN genome及其对性状影响的新认识。

Maize pan-transcriptome provides novel insights into genome complexity and quantitative trait variation​

http://www.nature.com/articles/srep18936​ 

祝贺各位!​

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(2016-01-01 18:58)
分类: 我们的文章

2015年最后两天,new phytologist  发表了我们的2篇文章。算新年礼物!

这个研究是我还没有回国就开始折腾的一个东西,希望把任意群体放在一起来分析,尽管结果并没有达到预期,但终究是发表出来了,谢谢中国农大和华中农大课题组无数老师学生的共同努力,特别致谢杨小红教授的贡献。

Genome-wide recombination dynamics are associated with phenotypic variation in maize

Qingchun Pan, Lin Li, Xiaohong Yang, Hao Tong, Shutu Xu, Zhigang Li, Weiya Li, Gary J. Muehlbauer, Jiansheng Li and Jianbing Yan

Article first published online: 31 DEC 2015 | DOI: 10.1111/nph.13810

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.13810/abstract 

Genome-wide dissection of the maize ear genetic architecture using multiple populations

Yingjie Xiao, Hao Tong, Xiaohong Yang, Shizhong Xu, Qingchun Pan, Feng Qiao, Mohammad Sharif Raihan, Yun Luo, Haijun Liu, Xuehai Zhang, Ning Yang,

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(2015-12-24 17:31)

水稻的竞争要多惨烈?而同一个基因此前也刚刚发表在Molecualr Plant

Nature Plants 刚刚发表了3篇文章,都是对同一个基因的功能解析。​

1.遗传所 储成才老师组

 Control of grain size and rice yield by GL2-mediated brassinosteroid responses

http://www.nature.com/articles/nplants2015195​ 

2. 遗传所 李云海老师组

Regulation of OsGRF4 by OsmiR396 controls grain size and yield in rice​

http://www.nature.com/articles/nplants2015203

3. 武汉大学 李绍清老师组

Blocking miR396 increases rice yield by shaping inflorescence architecture​

http://www.nature.com/articles/nplants2015196

此前的MP 是来自水稻所的钱前老师组

A Rare Allele of GS2 Enhances Grain Size and Grain Yield in Rice​

http://www.cell.com/molecular-plant/abstract/S

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(2015-11-24 11:14)
分类: 每周推荐

李青的又一篇大作,热点都在题目上了,已经开始超越我的知识范围了!大赞!


RNA-directed DNA methylation enforces boundaries between heterochromatin and euchromatin in the maize genome

  • Qing Li, Jonathan I. Gent, Greg Zynda, Jawon Song, Irina Makarevitch, Cory D. Hirsch, Candice N. Hirsch, R. Kelly Dawe, Thelma F. Madzima, Karen M. McGinnis, Damon Lisch, 
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(2015-09-24 14:39)
标签:

育儿

分类: 每周推荐
秦峰老师的大作,抗旱的自然变异!非常漂亮!

如果抗旱能做如此漂亮的工作,那其它任何性状都应该可以!换一句话说,任何性状都适合关联分析,关键在于你的表型鉴定!

另外一点 comments 是:转座子,转座子的作用比我们想象的大,目前的参考基因组不够,二代测序也不够!

A transposable element in a NAC gene is associated with drought tolerance in maize seedlings

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    (2015-09-15 21:59)
    分类: 每周推荐

    再comment 几句:认真看完了,堪称经典的遗传学分析文章,可以在遗传学课堂上讲相斥连锁的时候用。文章写得也行云流水,通俗易懂。

    余建明老师的大作,给杂种优势的 over dominance (pseudo-overdominance) 提供了一个直接的例子!

    Dissecting repulsion linkage in the dwarfing gene Dw3 region for sorghum plant height provides insights into heterosis

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    (2015-09-10 13:01)
    分类: 其它

    能够在一流刊物发表文章应该是很幸福的事情,然后在致谢里除了感谢那个她无私的连续不断的支持外。还公开的求婚,“XX, will you marry me?' 是不是很COOL?!

    你也想试试么?:)

    这是今年发表在 current biology ​25:1641-1648 的一篇文章的致谢:


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    (2015-09-04 18:16)
    标签:

    杂谈

    分类: 成长的默默


    9月3日,北京的天气很好,天空像一块覆盖在大地上的蓝宝石。长安街两侧高楼林立,天安门广场看台上人山人海。

    阅兵开始了,第一个让我感动的是老兵方阵。他们已经满头白发,还敬着军礼参加阅兵,代表着那些牺牲的新四军,共产党,国民党战士。

    士兵方阵出场是那么整齐,一个正方形一个正方形地走了出来,非常有纪律,以后我也要向他们学习。

    武器装备出场,我觉得我国的武器装备越来越强了,以后再也不怕被别的国家欺负了。

    飞机飞过,子弹一样喷出的烟雾像彩虹一样美丽。

    习主席和外国领导人出场拍照时好帅啊!

    最后和平鸽满天飞舞,好像在说:‘和平的世界多美好!’气球飞上天空,合成一个大大的爱心气球,形成了气球森林,我多想住在里面啊!
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