而我们在文章中，可以获得的往往是SRA编号，如：

http://s8/mw690/0025Np4Vzy6YQdnjwJ9a7&690SRA数据" TITLE="【数据下载】如何批量下载NCBI SRA数据" />

那么该怎么来批量下载SRA060929中的所有或某几个样本的数据呢？

Step1：打开NCBI的SRA页面（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/），并输入SRA060929，点击search；如下，

http://s9/mw690/0025Np4Vzy6YQeyfUXS48&690SRA数据" TITLE="【数据下载】如何批量下载NCBI SRA数据" />

Step2：获得页面如下，勾选需要下载的样本左侧，按下图指示勾选网页右侧内容，最后点击Create File 控件，网页会自动下载生成SraInforun.csv文件；

http://s6/mw690/0025Np4Vzy6YQhHMuYl25&690SRA数据" TITLE="【数据下载】如何批量下载NCBI SRA数据" />

SraInforun.cs文件格式如下：
http://s15/mw690/0025Np4Vzy6YQhIxYLkfe&690SRA数据" TITLE="【数据下载】如何批量下载NCBI SRA数据" />

Step3：

将上图中download_path列的链接放入下载工具中，即可下载对应的SRA文件；

如果使用Linux系统，则可以直接用wget 命令批量下载文件；

下载后的SRA文件可以用sratoolkit的fastq-dump工具转换成fastq格式，以进行后续各种分析。（sratoolkit.2.3.5-2-centos_linux64/bin/fastq-dump）

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