加载中…
个人资料
唐明智
唐明智
  • 博客等级:
  • 博客积分:0
  • 博客访问:150,227
  • 关注人气:178
  • 获赠金笔:0支
  • 赠出金笔:0支
  • 荣誉徽章:
相关博文
推荐博文
正文 字体大小:

测序常见问题深度解析(三)碱基缺失

(2011-05-09 22:26:43)
标签:

DNA

测序

峰图

序列

克隆

碱基

缺失

杂谈

分类: 测序常见问题分析

碱基缺失其实是双模板的一种特殊形态,某一样品在某一碱基后包含两类片段,其中一条片段比另一条片段少(或多)几bp或几十bp,因此在峰图上表现为从某处开始为两个峰的叠加,碱基缺失多发生在PCR测序中,并在峰图上表现出一定的规律。

1.单碱基缺失

一个模板比另一模板少一个碱基,在峰图重叠峰的区域规律性的表现为每一个大峰信号后面(或前面)都有一个相同小峰信号,如下图:

测序常见问题深度解析(三)碱基缺失


 

1.多碱基缺失

多碱基缺失的峰图也表现为从某处开始为两个峰的叠加,但峰图更为复杂,想要迅速找出规律十分困难,特别是多碱基缺失发生在不只一个位点时。

如下图的两个峰图中,下面的峰图为单一的模板,上面的峰图包含一个与上述相同的模板和一个缺失10个碱基的模板,并伴随着个别碱基的变异。

测序常见问题深度解析(三)碱基缺失

碱基缺失其实不是测序问题,更多的是提供了我们一种有用的信息,在疾病检测,基因定位方面有着重要的意义。


                                                        本文版权归个人所有,如需转载请注明出处

                                            唐明智



 


 

0

阅读 评论 收藏 转载 喜欢 打印举报/Report
  • 评论加载中,请稍候...
发评论

    发评论

    以上网友发言只代表其个人观点,不代表新浪网的观点或立场。

      

    新浪BLOG意见反馈留言板 电话:4000520066 提示音后按1键(按当地市话标准计费) 欢迎批评指正

    新浪简介 | About Sina | 广告服务 | 联系我们 | 招聘信息 | 网站律师 | SINA English | 会员注册 | 产品答疑

    新浪公司 版权所有