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DNAstar软件的使用(四)Seqman 去除载体

(2011-05-08 11:30:14)
标签:

dnastar

测序

载体

序列

峰图

杂谈

分类: 生物软件的使用

插入到载体上的片段在分析前需要先去除载体序列,而Seqman 提供了自动去除载体的功能,你只需选择你的载体类型即可,点击图中的下拉框即可看到软件自带的载体文件

DNAstar软件的使用(四)Seqman <wbr>去除载体

 

选择好前后载体后,导入文件的Vector一栏会有显示,注意两栏都要选上

DNAstar软件的使用(四)Seqman <wbr>去除载体

 

选好之后点击Options会弹出一个对话框,点击Scan All即可

DNAstar软件的使用(四)Seqman <wbr>去除载体

 

扫描完成后,如果导入序列与目标载体类型匹配载体明称之前会显示√,表两者相匹配。

DNAstar软件的使用(四)Seqman <wbr>去除载体

双击文件名会弹出峰形图并显示载体序列的位置,插入片段开始与结束的位置也一目了然。

DNAstar软件的使用(四)Seqman <wbr>去除载体

如在下拉框中找不到你的载体,点击菜单栏的Project---Vector catalog


DNAstar软件的使用(四)Seqman <wbr>去除载体


接着弹出载体编辑工具,在这里可以新建或编辑一个载体文件,新建载体文件需要先把载体的序列文件(.Seq格式)放入到安装目录的VectorData文件夹下,在这个文件夹也可以找到已有的载体序列

DNAstar软件的使用(四)Seqman <wbr>去除载体


 

然后点击New,导入载体的序列文件,设置好克隆位点在载体上的位置,以及需要将载体序列与测序结果比对的区间即可

DNAstar软件的使用(四)Seqman <wbr>去除载体

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