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铁汉1990
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【T】每日一生信--遗传变异主要的数据库

(2013-11-07 20:22:00)
标签:

遗传变异主要的数据库

分类: bioinformatic
该博文更新已整理到新地址:
    1986年开发的swiss-prot这样的一个数据库,影响蛋白变异的数据放在其中。
    1988年在NCBI建立了dbSNP这个数据库,主要是在Hapmap计划的推动下,测量了很多正常人里面出现的单核苷酸变异,也包括insertion/deletion。主要是存储所有被鉴定出来的遗传变异,包括正常人和病人的
    2010年,NCBI建立dvVav数据库,主要是存储一些比较大一点的结构变异
    2012年,发表了一个千人基因组,测了1000多个人的基因组,现在已经测了2000多个人的基因组,当然测序深度不是完全一样
    1960年,疾病相关的变异数据库最早叫做OMIM(online mendelian inheritance in man)
    1996年,Human Gene Mutation Database被建立,它是存储遗传变异相关的数据
    2007年,Locus Specifical Database建立,它是专门针对每一个不同Locus,把相关的遗传变异汇总起来
    2012年,ClinVar
    2004年,COSMIC数据库,主要存储的是癌症里面的体细胞突变。
【T】每日一生信--遗传变异主要的数据库
   ps:此本文内容来自魏丽萍老师的课件

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