1、EndNote X4不能将修改后的格式文件保存在原始文件夹（安装EndNote X4时的默认保存output style的文件夹）下面。放在其它的位置就可以了，如
C:\Documents and Settings\用户名\Application Data\EndNote

2、可以修改自定义output style保存位置

首先打开你的endnote点击edit－进入preferenc－然后点击fold location，将style fold修改为D:\program files\EndNote X4\Styles（其它文件夹也可以，只要不是原始文件夹即可）
按照以上操作即可解决styles修改后无法保存的问题。