在治疗性功能障碍之前，尽可能地先去除各种诱发因素及危险因素。因为某些诱因和危险因素是可以克服的，如药物因素、吸烟、酗酒、吸毒以及改善夫妻关系等。同时加强原发疾病的治疗。如：糖尿病、高血压、高血脂、内分泌疾病。
各种性功能障碍的治疗必须在明确的定位诊断和病因学诊断的基础上，才开始着手制定治疗方案。如果诊断正确治疗得当目前治疗ED的综合疗效达80%以上；治疗早泄的综合疗效也在80%以上；治疗插入障碍的综合疗效在90%以上；治疗性欲低下和逆行射精的疗效较低。以治疗ED为例，方法很多，不妨分步进行：第一步先行药物治疗，如西地那非、伐地那非、他达拉非、中药，同时配合心理行为治疗和VCD治疗；这一方案如果无效应找出失败的原因进行调整，或选择二线治疗：ICI或尿道给药；若第二线治疗依然无效。可选择手术治疗。目前我们一般采用阴茎支撑体植入术，并以可胀性阴茎支撑体植入术为多。由于血管手术治疗的远期效果较差，目前许多医院已很少使用。阴茎支撑体植入是治疗重度ED的最终选择。因此，确保手术的安全性、可靠性和有效性最为重要。仅管科学在不断发展，手术技术和支撑体质量在不断改进和提高，但任何技术和手术方式都不是100%的完美。因此，术前应让患者了解可能存在的手术后果和潜在的并发症。对合并有严重内科疾病、精神病、抑郁症、个性障碍、手和眼配合不良，以及由严重婚姻问题的ED患者不宜做此手术。
阴茎支撑体手术的注意事项：①切口应足够大；②扩张阴茎海绵体时应达到尖端，使支撑体能贴于龟头下，以免术后屈曲；③支撑体的长度适当，若太长会引起阴茎头部和坐骨结节部的疼痛，太短会引起阴茎屈曲；④术中应避免损伤尿道海绵体，若不小心损伤了尿道或尿道海绵体最好停止手术，待损伤愈合后再作第二次手术；⑤术中严格无菌操作，以防感染发生；6术后第2-3天应经常向下牵拉水泵，使其保持在阴囊的低位，并减少连接管扭曲。
性功能障碍的患者或多或少会存在心理障碍因素，因此，在综合治疗过程中配合心理治疗。
在进行心理治疗前必须帮助患者找到造成心理障碍的因素，如性知识缺乏；感情投入不足，缺乏激情；缺乏相互的交流、亲热；缺乏有效的性刺激；消极的注意和不愉快的回忆；婚前或新婚时性交的失败；婚姻关系的紧张；生活中挫折、事业上的失败，造成精神抑郁等等。在明确病因的基础进行针对性的治疗就会产生效果。
临床上常用的有支持疗法，帮助患者建立信心；认知疗法，帮助患者克服错误的认识，建立新的科学认知；脱敏疗法，一而再，再而三地刺激他，使他对造成心理障碍的因素产生脱敏。至于性治疗在国外流行了许多年，笔者也尝试过这种方法，由于种种原因没有使这种方法开花结果。严重的心理障碍病人应找专业心理医师配合治疗。
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