马岙古文化遗址群位于定海区马岙镇。相传定海区马岙有九十九个土墩，２００２年经进一步调查核实，有名可叫的土墩有４９个。大小不一、高低在１～３米不等，由熟土堆积而成的土墩群，从现三胜村向盘由西北向东南至光四村的杜家墩，在卧佛山脚北约五六百米呈半圆形排列，呈扇状展开。它由于海潮的不断涨落及山上水土的持续冲击，长年累月逐步形成的。土墩背山临水，土壤肥沃，附近水产品十分丰富，是古人类理想的居住场所。自２０世纪７０年代开始至今，各村在窑厂取烧砖瓦和毛昭晰等考古专家的几次试挖中发现大量新石器及各个时代人类活动的遗存，经专家对出土文物考证后，认为马岙已有五六千年人类活动的历史，并具有鲜明的海洋文化特征，其文化内涵系河姆渡文化晚期，与良渚文化同期。１９８４年，经市文管会普查，具有丰富的文化内涵土墩有２９处，其中属新石器时代的１２处，商周时期８处，文化层厚０．６～０．８米不等，先后出土了自新石器时代至商周、春秋战国、秦汉直到明清等各个年代文物５００多件，出土文物有石器、陶器、瓷器、石纺轮、骨器、古窑址、金银青铜器等和贝壳、蛤蜊海洋生物及鹿角等动物骨胳。

    马岙古文化遗址群是舟山群岛迄今发现的规模最大、保存最完整、内涵最丰富的原始村落遗址，其中凉帽蓬墩、长墩和洋坦墩三个古人类居住遗址１９９４年被列为定海文物保护单位，设有标志牌，并在保护区四周立有界桩，１９９７年９月凉帽蓬墩遗址被公布为第四批省级文物保护单位，２０００年２月马岙被省政府批准为省级历史文化保护区。马岙还是古代中日文化交流的中继站，它早在五千年前开始种植水稻，并作为中华民族的一项灿烂文明传播到日本。１９９４年３月，马岙文物史迹陈列室开馆展出，１９９８年１１月，马岙镇兴建马岙博物馆，２００１年５月，总投资５００余万元，占地５亩，建筑面积１２６０平方米的博物馆完成陈列布展，正式对外开放。共展出文物２００余件，分海洋第一村展厅、海盐生产展厅、海岛民风习俗展厅和流动展厅。开放至今已累计接待海外友人６００余人次，国内游客１２０００余人次。２００２年２月，完成历史文化遗产普查。马岙历史文化保护区现有各类文化遗产２４处，其中古文化遗址类８处，古民居类６处，水利类６处，其他４处。马岙古文化遗址群是舟山史前文化不可或缺的重要组成部分，对于研究古人类与海洋关系即人类向海洋拓展进程及海洋文化的发展具有重要价值；也为东瀛文化的探源提供了实物佐证，在研究古代中日文化交流传播中具有重要地位。

    １９９５年８月，马岙古文化遗址被舟山市政府命名为舟山市爱国主义教育基地。