如何筛选具有高效防病促生作用的皮尔瑞俄类芽胞杆菌菌株?
标签:
知识方法作用收藏 |
分类: 微生物菌种 |
如何筛选具有高效防病促生作用的皮尔瑞俄类芽胞杆菌菌株?
百欧博伟生物:筛选具有高效防病促生作用的皮尔瑞俄类芽胞杆菌(Paenibacillus peoriae)菌株,需结合其生理特性、功能靶点(防病 / 促生)及实际应用场景,通过“分离纯化→初筛→复筛→综合验证”的阶梯式流程实现,核心是确保筛选指标与“高效性”“稳定性”“实用性”匹配。以下是详细筛选方案:
一、筛选前准备:明确核心目标与关键指标
在筛选前需定义“高效”的量化标准,避免盲目筛选。参考农业应用需求,核心指标如下:
功能类型
高效防病 1.对目标病害的离体抑菌率≥70%;2.活体盆栽防效≥60%;3.能稳定产生抑菌物质 需覆盖 1-2 种主要靶标致病菌
高效促生 1.产生长素≥50 μg/mL;2.固氮能力≥10 mg N/g 底物;3.溶磷量≥200 μg/mL; 促生指标需结合目标作物的需求
实用性 1.生长温度适应范围广;2.耐酸碱、耐低盐;3.传代 5 次后功能保留率≥80% 确保菌株能适应田间环境及工业化生产
二、第一步:菌株分离纯化 —— 从“高潜力生境”富集目标菌
皮尔瑞俄类芽胞杆菌多存在于植物根际土壤、健康植物组织(内生)、病害发生区的抗病植株根际(长期自然选择下易富集抗病菌株),需优先从这些生境采样,提高筛选效率。
1、样品采集
采样生境:优先选择 3 类场景:
连作障碍田(如黄瓜、番茄田)中“健康植株根际土”(可能富集拮抗病原菌的菌株);
已发生目标病害的田块中“抗病单株的根际 / 茎秆内生”(菌株可能已形成对病原菌的竞争优势);
有机种植田的作物根际(减少化学农药对菌株的抑制,保留多样功能菌)。
采样方法:根际土需取“植株根系附着的 0-10 cm 表层土”,去除杂质后装无菌袋;内生菌需取茎秆 / 根系,表面消毒(75% 乙醇 30s→0.1% HgCl 1min→无菌水冲洗 3 次)后研磨。
2、分离纯化(基于生理特性的选择性富集)
利用皮尔瑞俄类芽胞杆菌“好氧、耐一定温度、革兰氏阳性”的特性,通过选择性培养基 + 温度胁迫排除杂菌:
富集培养:将样品(根际土 10g / 内生组织研磨液)加入含 100mL NA 培养基(营养琼脂) 的三角瓶,30、180rpm 振荡培养 24h(好氧富集);之后取 1mL 培养液,在 80水浴中处理 10min(杀死非芽胞菌,保留类芽胞杆菌的芽胞)。
稀释涂布:将热处理后的菌液梯度稀释(10~10),取 0.1mL 涂布于PA 培养基(选择性培养基,含 5μg/mL 氨苄青霉素,抑制革兰氏阴性菌) ,30倒置培养 48h。
单菌落纯化:观察菌落形态(皮尔瑞俄类芽胞杆菌典型菌落:圆形、表面光滑、乳白色、边缘整齐,直径 2-3mm),挑取符合形态的单菌落,在 NA 平板上划线纯化 3 次,获得纯菌株。
三、第二步:初筛 —— 快速排除无功能菌株(低成本、高通量)
初筛以“表型特征 + 基础功能”为核心,通过简单实验快速筛选出具有“防病 / 促生潜力”的菌株,减少后续复筛的工作量。
1、菌株身份验证:排除非目标菌
初筛阶段需先确认菌株为Paenibacillus peoriae,避免错筛:
形态与生理验证:革兰氏染色(阳性,杆状)、鞭毛染色(周生多鞭毛)、运动性观察(半固体培养基穿刺,可见扩散生长);
分子鉴定:提取菌株基因组 DNA,扩增16S rRNA 基因(通用引物 27F/1492R)和类芽胞杆菌属特异性基因gyrB(引物 gyrB-F/gyrB-R),测序后与 NCBI 数据库中P. peoriae 模式菌株比对,同源性≥99% 可确认为目标菌。
2、防病潜力初筛:离体抑菌实验(高通量)
采用“平板对峙法 / 抑菌圈法”,快速检测菌株对靶标病原菌的拮抗能力:
靶标病原菌选择:根据目标作物确定,如针对蔬菜可选:
细菌性病原菌:黄瓜细菌性软腐病菌(Erwinia carotovora)、番茄青枯病菌(Ralstonia solanacearum);
真菌性病原菌:黄瓜炭疽病菌(Colletotrichum orbiculare)、西瓜蔓枯病菌(Didymella bryoniae)。
实验方法:
平板对峙法:在 PDA 平板中央接种病原菌菌饼(直径 5mm),距中央 2.5cm 处接种纯化的皮尔瑞俄类芽胞杆菌(点接,直径 2mm),30培养 3-5d,测量“抑菌圈宽度”(病原菌菌落与细菌菌落间的空白距离),宽度≥5mm 为有潜力菌株;
抑菌圈法:将病原菌菌悬液(10 CFU/mL)均匀涂布于 PDA/NA 平板,放置无菌牛津杯(直径 8mm),加入 100μL 皮尔瑞俄类芽胞杆菌发酵液(30振荡培养 48h,离心取上清),培养后测量抑菌圈直径,直径≥15mm 为高效潜力菌株。
3、促生潜力初筛:基础促生特性检测
针对“产 IAA、固氮、溶磷”3 个核心促生功能,采用定性 / 半定量方法初筛:
产 IAA 检测(Salkowski 比色法):将菌株接种于含 L - 色氨酸(1g/L)的 LB 液体培养基,30振荡培养 48h,取上清 1mL+2mL Salkowski 试剂(50mL 35% HClO + 1mL 0.5mol/L FeCl),避光反应 30min,若溶液呈粉红色,说明产 IAA(颜色越深,产量越高);
固氮能力检测(无氮培养基培养):将菌株接种于Ashby 无氮培养基(不含氮源,仅含碳源和矿物质),30培养 7d,能正常生长(菌落直径≥2mm)说明具有固氮潜力;
溶磷能力检测(溶磷圈法):将菌株接种于Pikovaskaia 溶磷培养基(含难溶性磷酸钙,pH 7.0),30培养 7d,观察菌落周围是否出现透明溶磷圈,计算“溶磷圈直径 / 菌落直径比值(D/d)”,比值≥2.0 为高效溶磷潜力菌株。
四、第三步:复筛 —— 精准量化功能,筛选“高效菌株”
初筛获得的菌株需通过定量检测 + 活体验证,排除“离体有效、活体无效”或“功能不稳定”的菌株,核心是“量化高效性 + 验证稳定性”。
1、防病功能复筛:从“离体”到“活体”,验证实际防效
第一步:抑菌物质定量与类型分析
对初筛高抑菌活性菌株,发酵后通过“高效液相色谱(HPLC)”检测其特征抑菌物质的含量(参考标准品峰面积定量),同时通过“蛋白酶 K 处理发酵液”(若抑菌活性下降,说明抑菌物质含蛋白质 / 多肽)、“酸碱处理(pH 2-10)”(验证抑菌物质稳定性),确保菌株能稳定产抑菌物质。
第二步:活体盆栽防效实验
以目标作物(如黄瓜、番茄)为材料,分 3 组处理:
对照组:仅接种病原菌;
菌株处理组:先灌根 / 喷雾皮尔瑞俄类芽胞杆菌菌悬液(10 CFU/mL),24h 后接种病原菌;
空白组:不接菌。
培养 15-20d 后,统计“病株率”“病情指数”,计算防效 =(对照组病情指数 - 处理组病情指数)/ 对照组病情指数 ×100% ,防效≥60% 为高效防病菌株。
2、促生功能复筛:从“实验室指标”到“植物表型”,验证促生实效
第一步:促生物质定量检测
对初筛阳性菌株,采用“高效液相色谱(HPLC)”精准定量 IAA 产量(需用 IAA 标准品绘制标准曲线);采用“钼蓝比色法”定量溶磷量(检测发酵液中可溶性磷含量);采用“凯氏定氮法”定量固氮量(检测无氮培养基中菌株固定的氮含量),确保指标达到“高效”标准。
第二步:活体促生实验
以无菌基质(如蛭石 + 珍珠岩 = 3:1)培养目标作物(如玉米、黄瓜),分 2 组处理:
处理组:每株灌根 10mL 皮尔瑞俄类芽胞杆菌菌悬液(10 CFU/mL);
对照组:灌根 10mL 无菌培养基。
培养 20-30d 后,测定“株高、根长、地上部鲜重、地下部鲜重”,计算促生率 =(处理组指标 - 对照组指标)/ 对照组指标 ×100% ,至少 2 项指标促生率≥20% 为高效促生菌株。
3、环境适应性与遗传稳定性验证
环境适应性:将菌株接种于不同条件的 NA 培养基(温度 5/15/30/40;pH 5.0/6.0/7.0/8.0;NaCl 浓度 1%/2%/3%),培养 48h 后测 OD(菌体浓度),确保在多数农田环境下(如低温 15、pH 6-8)能正常生长(OD≥1.0);
遗传稳定性:将菌株连续传代 10 次,每次传代后检测“抑菌率”“IAA 产量”,若功能保留率≥80%,说明遗传稳定(避免工业化生产中功能丢失)。
五、第四步:综合评价与筛选 —— 确定最终高效菌株
通过上述步骤后,需对菌株进行多维度综合评分,筛选出“防病 - 促生 - 适应性”均优的菌株,评分标准参考如下:
评价维度 权重 评分标准(100 分制)
防病能力 30% 活体防效≥70%(30 分);60-70%(20 分);<60%(0 分)
促生能力 30% 2 项指标促生率≥25%(30 分);1 项≥25%+1 项≥20%(20 分);<20%(0 分)
环境适应性 20% 40/pH 5.0/3% NaCl 下均能生长(20 分);2 项达标(10 分);1 项达标(5 分)
遗传稳定性 20% 传代 10 次功能保留率≥90%(20 分);80-90%(10 分);<80%(0 分)
最终筛选标准:综合评分≥80 分,且至少对 1 种靶标病害防效≥60%、1 项促生指标≥25% 的菌株,即为“高效防病促生皮尔瑞俄类芽胞杆菌菌株”。
六、关键注意事项
多生境采样:至少采集 5-10 个不同生境的样品,增加菌株多样性,提高筛选到“高效菌株”的概率;
多靶点筛选:防病需覆盖“细菌 + 真菌”类病原菌,促生需检测“产 IAA + 固氮 / 溶磷”,避免菌株功能单一;
结合实际应用场景:若目标是“低温地区农田”,需强化菌株的低温生长能力(5-15)筛选;若用于“盐碱地”,需提高耐盐(≥3% NaCl)筛选标准;
分子辅助筛选:可通过 PCR 扩增“抑菌基因(如脂肽合成基因fenD)”或“促生基因”,快速预判菌株功能,缩短筛选周期。
通过以上流程,可系统性筛选出兼具“高效性、稳定性、实用性”的皮尔瑞俄类芽胞杆菌菌株,为后续农业应用(如生物菌剂研发)提供核心菌种资源。
北京百欧博伟生物技术有限公司的微生物菌种查询网提供微生物菌种保藏、测序、购买等服务,是中国微生物菌种保藏中心的服务平台,并且是集微生物菌种、菌种,ATCC菌种、细胞、培养基为一体的大型微生物查询类网站,自设设备及技术的微生物菌种保藏中心!欢迎广大客户来询!

加载中…