加载中…
博文
        信号转导通路(Signaling pathway)本身就是一种机制,或者说是一种过程,在这个过程中,一个信号到达细胞后(细胞表面,或者是细胞内部),这个信号就会触发一系列有序的事件(信号转导通路),最终导致细胞内出现一些变化。这些变化通常伴随着基因的表达或者是某些物质浓度的变化,这些事件能够使细胞对某种信号作出反应,并根据当前环境调整细胞自身的代谢活动。

        信号转导通路始于某个信号本身,这个信号分子与细胞表面的信号分子受体结合,受体通过大量的不同的蛋白来将信号传递到细胞内部。从本质上来说,衔接蛋白(adaptor protein)与脚手架蛋白(Scaffold protein)都位于前述的这些蛋白集合中,它们负责将信号从受体进一步传递到细胞内部。
        衔接蛋白与脚手架蛋白的区别就在于它们的功能和结构上的不同。脚手架蛋白的作用是通过“吸引”大量的,信号转导通路所需的不同蛋白
标签:

质粒

限制性内切酶

图片中的这个质粒长度为7338bp,其中含有1200bp的插入片段,现在我们使用两个限制性内切酶来切这个质粒,这两个限制性内切酶分别为HindII与BamHI,酶切的结果如下所示:
 

第一条泳道是DNA marker,范围是500bp到10000bp;

第二条泳道是没有切的质粒,作为对照,在这一条泳道中的质粒可能含有三种构象。
第一种是超螺旋,它结构致密,在凝胶中运动最快,我们可以看到这个片段。
第二种是含有切口的质粒,在质粒DNA复制过程中,

Tan, X., et al. (2018). 'Detection of Microbial Infections Through Innate Immune Sensing of Nucleic Acids.' Annu Rev Microbiol 72: 447-478.

这篇综述是2018年发的,总结了天然免疫系统是如何识别病体核酸的,我觉得总结得比较好,就花了两天时间翻译了一下。

摘要:先天性免疫系统通过胚系编码的模式识别受体(PRR,Pattern recognition receptor)来识别微生物的入侵。由于大多数微生物病毒在其生命周期中都含有DNA和/或RNA,因此对于核酸的识别是宿主先天性免疫防御的一个重要策略。病原体来源的核酸可以被特定的宿主PRR识别,这些PRR位于内体溶酶体(endolysosome)和细胞质中。PRR的活化能触发信号级联反应,造成IFN-I和促炎症细胞因子的积累,导致宿主细胞处于抗菌状态,激活

(2018-12-27 12:12)
标签:

coip

免疫学

蛋白相互作用

最近读了一篇文献,里面使用了一些CoIP实验,搜索了相关资料,以及向实验室做蛋白相互作用的高手求教了之后,总结了CoIP的笔记。

文献信息如下:
Abe, T., et al. (2017). 'Germ-Cell-Specific Inflammasome Component NLRP14 Negatively Regulates Cytosolic Nucleic Acid Sensing to Promote Fertilization.' Immunity 46(4): 621-634.

CoIP的原理图,如下所示:
 

        在做miRNA的相关实验中,在验证靶基因方面,通常是向靶细胞转染miRNA mimics,或者是构建稳定过表达的miRNA的细胞株,然后做WB即可。我的靶细胞是RAW264.7,但向这种细胞株转染miRNA mimics时,使用lipo2000lipo3000的效率没那么高,不太容易做出结果(文献中有人使用的,效果很好,但我实验中总是做不出来)。后来在QIAGEN官网上搜到了一个转染试剂,HiPerFect,看介绍这个转染试剂是专门用于转染miRNA的。以下是实验流程,具体实验我还没做,只是翻译了说明书中的内容。

1.   &n

(2018-11-14 14:27)
这个实验流程包括质粒的转化到挑菌这一步。

第一步:转化
1. 质粒1uL加入10ul的感受态细胞中,冰上放置40min。
低温的作用是让DNA-CaCl2复合体粘着在菌体表面。
2. 42水浴锅内热激90s(让质粒进入感受态细胞)。
短暂热激的作用是让菌壁通透性改变,再经过2min左右冰上静置,附着在表面上的DNA就进入菌体了。
3. 取出,冰上放置5min(让感受态细胞关闭)。
4. 加入1mL LB液体培养基(无抗性AMP),37摇床培养1h。
5.     8000转离心5分钟,弃去
(2018-04-09 17:30)
标签:

kegg

生物信息学

1. 什么是通路分析?

标签:

mirna-seq

生物信息学

样本RNA要求

  1. 总RNA质量:≥ 3.0 μg
  2. RNA 浓度: ≥ 50 ng/μl
  3. RIN值 ≥ 7.5(植物与真菌),RIN值 ≥
标签:

qpcr

mirna

taqman

1. TaqMan探针检测MiRNA的原理是什么?
答:在PCR的过程中,TaqMan MGB探针会特异性地结合到与其互补的序列上,这个序列在下游引物与下游引物之间,如下所示:

图例如下:
 
标签:

r语言

excel数据读取

excel

  R语言中如果要读取以下的Excel表格文件:

http://s16/mw690/001IAGNuzy7at8eFALRff&690
 操作如下所 

  

新浪BLOG意见反馈留言板 欢迎批评指正

新浪简介 | About Sina | 广告服务 | 联系我们 | 招聘信息 | 网站律师 | SINA English | 产品答疑

新浪公司 版权所有