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牛牛龙
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1. BeadArray简介
BeadArray是Illumina公司研发一种“滚珠”芯片。芯片结构如图所示:
2. 数据类型
pix-level data:可以获得芯片原始TIFF图像。这种格式的数据信息量最大、最原始,同时格式也是最大,因此也被成为Raw data。bead-level data:可以获取每张BeadArray的每个bead的探针密度和位置信息。以上两种数据格式需要有:1. text文件(必须
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标签:

vnc

远程桌面

防火墙设置

分类: Linux
VNC可以用于远程桌面控制,非常方便,甚至可以在浏览器中使用。以下是配置方法:

1. 服务器和客户端安装vnc及其相关组器
# yum install vnc
# yum install vnc-server
# yum install tigervnc-server-applet  

2. 服务器配置vnc
首先,配置vnc文件,目录/etc/sysconfig/vncservers
添加以下内容
=======================================
VNCSERVERS='1:root 2:testusr'
VNCSERVERARGS[2]='-geometry 1024x768'
VNCSERVERARGS[1]='-geometry 1024x768'
========================================
第一行:为root和testusr用户编号
第二行和第三行:为用户1和2设置桌面和分辨率

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(2013-01-19 19:11)
需要三个软件
1. ppt
2. iptables
3. pptp 
前两个直接yum install解决,最后一个查看http://poptop.sourceforge.net/yum/stable/packages/,选择适合自己系统的版本安装。


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标签:

markdown

css

样式调整

html文档

分类: Linux
可以使用CSS美化markdown编排的文档,以下是几个推荐的CSS文件简介和地址。

1. 这是一个引用广泛的CSS文件,文档背景采用的浅色。一个比较吸引人的地方,“文本块”左侧使用一根灰色线条区分,非常别致。
使用方法:在markdown文档开头添加
<link href='http://kevinburke.bitbucket.org/markdowncss/markdown.css' rel='stylesheet'></link>

2. 以上版式还对应一个深色背景。
使用方法:如上,开头添加
<link href='http://github.com/yrgoldteeth/darkdowncss/raw/master/darkdown.css'rel='stylesheet'></link> 

3. 一个markdown专用的CSS文件集合,包括五种不同的样式。其中浅色背景和深色背景与上述类似;另一个浅色背景,代码部分用方块标
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标签:

markdown

语法

快速入门

分类: Linux
Markdown就是用来快速写文档:不用word,没有LaTeX复杂,比纯文本好看实用,而且通过Pandoc快速转换成HTML/LaTeX等,Markdown实在是一个利器。而且,语法实在简单,跟着参考网址1,10min学会。

1. 标题
atx方法标记,开头#,#数量表示标记等级。
# 表示一级
## 表示二级
以此类推,共1~6个级别。


2. 文档书写
注释:与HTML注释相同,即<!--<comment>-->

空行:空行可以区分段落。如果行与行之间没有空行,则被视为一行。

> 开始表示“文本块”,即HMTL的<blockquote>标签;“文本块”可以任意使用其他markdown代码,比如标题,列表,嵌套“文本块”。

分割线
连续三个*号

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标签:

emacs

markdown

配置

分类: Scheme
1. 安装emacs-goodies-el插件集合
# yum install emacs-goodies-el
默认安装目录是/usr/share/emacs/site-lisp/goodies

2. 配置.emacs文件
在~/.emacs中添加如下内容
============================================================
(autoload 'markdown-mode 'markdown-mode.el'
   'Major mode for editing Markdown files' t)
(setq auto-mode-alist
   (cons '('\\.markdown' . markdown-mode) auto-mode-alist))
=============================================================

3. 安装pandoc
# yum install pandoc

4. 设置emacs
在emacs中直接使用pandoc编辑mar
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(2012-12-08 16:46)
标签:

latex

图片

表格

图例

分类: LaTeX
1. 加入图片和设置字体方向

\includegraphics[⟨key-val options⟩]{⟨filename⟩}:插入图片。⟨filename⟩表示图片名称(无后缀的图片名称,可以是pdf/png/jpg格式图片),如果图片名称中有空格或者多个点号,需要使用grffile包;⟨filename⟩也可以表示绝对路径,比如文件“pictures\shapes.pdf”可以表示为\includegraphics{pictures/shapes}⟨key-val options⟩是一些控制图片的命令:angle=⟨x⟩(逆时针旋转多少度),width=⟨length⟩/height=⟨length⟩ ,scale=⟨value⟩ ,trim=⟨l⟩ ⟨b⟩ ⟨r⟩ ⟨t&#10217
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Emacs是一个非常出色的工具,所有的一切都可以集成在这个文本编辑器中。下面介绍在emacs中实现字典查询和自动拼写检查的功能。

1. emacs字典查询功能
在Linux中,最钟情的还是StarDict。所以,首先我们看看以StarDict字典进行查询的方法。
1.1 命令行查询
sdcv可以实现命令行查询,安装方法:
# yum install sdcv
使用方法:
$ sdcv geek

1.2 emacs直接查询
如果能在StarDict中直接调用StarDict的字典查询,就会非常方便。推荐使用sdcv-mode.el,下载地址:http://code.google.com/p/sdcv-mode/
安装方法:将下载的sdcv-mode.el文件放在~/.emacs.d/plugins/目录下(也可以放在~/.emacs.d/的其他目录下,以下设置随之变化即可)。之后,在~/.emacs文件中添加:
===============================================
(add-to-list 'load-path '~/.emac
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linux默认安装文件位置:
1. yum源配置文件位置 /etc/yum.repos.d/***.repo
2. apache配置文件位置 /etc/httpd/conf/httpd.conf
3. iptables(防火墙)配置文件位置 /etc/sysconfig/iptables 
4. SElinux配置文件位置 /etc/selinux/config 
5. 字体库目录 /usr/share/fonts/
6. hosts文件目录 /etc/hosts
7. Emacs包默认安装目录 /usr/share/emacs/site-lisp/
8. ssh配置文档 /etc/ssh/sshd_config
9. vnc配置文档 /etc/sysconfig/vncservers  单独用户配置文件~/.vnc/xstartup

linux系统命令
1. 禁止SElinux  # setenforce 0
2. 启动/充启 httpd服务 # service httpd start/restart
3. 启动/重启iptable服务 # service iptables start/
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现在大多数网络运营商都不给家庭和个人用户分配独立固定IP地址。因此,如果需要使用动态IP地址配置网络服务器,需要使用相应软件解析动态域名。以下是使用“花生壳”(http://www.oray.com/peanuthull/)配置apache服务器方法:

1. “花生壳”配置

有两种方法安装“花生壳”:
1.1 下载安装包:“花生壳”在Windows和Linux都可以运行,可以去网站下载相应软件,根据提示安装,非常简单。
1.2 路由器自带:从“花生壳”网址中可以查询支持的硬件厂商,http://www.oray.com/peanuthull/embed.php。大多数路由器生产厂商,比如TP-LINK,D-LINK等,都将“花生壳”内嵌在硬件中。在路由器配置界面,可以方便操作。

在“花生壳'网站注册账号,并将在域名供应商处,将域名的DNS映射到花生壳域名解析服务器上。这一步骤需要一些时间,可能需要2h左右。如果是使用“花生壳”提供二级域名,则省略这一步。

DNS修改
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